[发明专利]用于鉴定生物样品中细菌的系统

说明书

相关申请的交叉引用

本申请要求全部于2008年2月5号提交的第61/026,300号、第61/026,309号、第61/026,324号、第61/026,336号、第61/026,357号和第61/026,374号美国临时申请的优先权，这些临时申请的全部内容通过引用并入本文。

技术领域

本发明涉及对生物样品(例如，尿液)中的微生物(例如，细菌)进行鉴定和定量的系统。更具体地，本发明涉及一种系统，其包括：一次性盒和具有渐缩(tapered)表面的光学杯或皿、包括光学读取器和热控制器的光学系统、光学分析仪、以及改进的分光仪。该系统可在样品处理器中采用一次性盒并在光学分析仪中采用光学杯或皿。

背景技术

通常，用于鉴定微生物(例如，尿液样品中的细菌)的当前实践包括复杂、漫长且昂贵的用于在微生物实验室中鉴定和明确微生物的过程。在当前过程中，实验室接收样品。然后，对这些样本进行分类、标记，随后通过无菌环将它们接种到血琼脂培养基上。随后将这些样本插入到专用培养箱中保持24小时。一天后，实验室技术员对这些样本进行阳性和阴性培养物的筛选。通常，大多数培养物是阴性的并采用手工报告。阳性培养物的有机体被分离并悬浮于生化流体中。这包括产生生化废弃物的悬浮、稀释、涡旋和浊度测量。随后将悬浮液暴露于多种试剂下对培养物进行种类鉴定和抗生素易感性测试。经过另一6至24小时的培养之后，实验室技术员解释和报告结果。整个过程通常采取11个步骤和花费50个小时来获得样本结果，该过程是劳动密集型的。

共有的第US 2007/0037135A1的美国申请公开文本公开了一种鉴定和定量悬浮于液体中生物样品的系统，该申请的内容通过引用并入本文。如该参考文献所公开，样品皿用于容纳(hold)生物样品。该参考文献陈述这些在本领域中被认为是众所周知的皿通常呈方形或矩形(具有容纳样品的井区域)，并且由例如玻璃的透明材料或聚合材料制成。然而，该参考文献未能公开所述皿的任何具体描述/设计。

因此尤其对于上述实验室程序的种类鉴定，需要提供一种具有更高效率、更少耗时且需要更少劳力的过程。还需要对光学杯或皿进行改进设计以及需要制造用于保持样品的光学杯或皿的方法，其中所述光学杯或皿可用于对样品进行光学分析的系统中。

发明内容

本发明的系统使获取样本结果的现有系统简化。本系统是环保的，允许快速诊断、结果一致、无需试剂，并可进行多功能诊断。根据共有的PCT申请US2008/079533所公开的一个实施方式，生物样品包含在一次性盒中，该一次性盒保持四个一次性部件，即一个离心管、两个具有不同容积的移液管吸头和一个光学皿。一次性盒具有与患者ID相关联的条形码。将一次性盒插入盒匣中，随后将盒匣插入处理样本的样品处理器中。将制备的样本转移至光学皿中，然后将盒匣插入分析样本的光学分析仪中。光学分析仪分析并产生能够对细菌进行最终处理的完整结果。本系统不需要老练的操作人员并能给出快速的结果。

根据一个可选实施方式，本系统包括多个一次性盒以用于容纳多个一次性部件，多个一次性部件包括离心管、具有1ml容积的移液管吸头和包含生物样本(例如，尿液)的光学杯或皿，其中光学杯或皿被特别成形为使容纳物的分析最优。每个盒具有与患者尿液样本相关联的条形码。离心管和移液管吸头可通常用于处理或制备用来分析的尿液样本，随后将最终处理的尿液样品转移至光学杯或皿中以用于在光学分析仪中进行光学分析。光学杯或皿包括具有下部渐缩区域的容器以有助于光学分析。也就是说，可将用于光学分析的紫外(UV)光源引导至光学杯或皿中。光学杯或皿可由透明材料(例如，ABS塑料或玻璃)制成，或可由金属材料(例如，铝)制成。如果光学杯或皿由透明材料制成，那么优选地，其涂覆或覆层有反射材料。具体地，光学杯或皿的内表面涂覆有反射材料或者包含反射材料层。可将一个或多个一次性盒插入盒匣中，随后可将盒匣插入样品处理器和/或光学分析仪中。当样品支撑在光学杯或皿中，且该光学杯或皿进而支撑在本发明的一次性盒中时，可对多达42份尿液样品进行处理并进行光学分析。样品或样本可以是生物样品、化学样品或毒性样品，包括例如用于对污染物(例如，细菌)进行光学分析的尿液样品。

在另一个实施方式中，本发明涉及上述的用于容纳例如生物样品、化学样品或毒性样品(例如，用于光学分析的尿液)的样品的光学杯或皿。如果该样品是尿液样品，则可对用于尿液中的微生物或有机体(例如，细菌)进行光学分析。光学杯或皿可以是矩形容器，并且优选为具有上部矩形开口和相对于矩形开口向内并向下延伸的渐缩区域的注射成型的塑料。