[发明专利]评估及治疗重度或持续性哮喘的标记物和方法

权利要求书

1.一种用于预测治疗对受试者中的TNF介导的疾病的适用性的方法，所述方法包括：

(a)用从受试者获得的样本制备核酸样品；

(b)使所述样品与由TNFRSF1A SNP rs4149581(SEQ ID NO：1)、TNFRSF1B SNP rs3766730(SEQ ID NO：2)或TNFRSF1B SNPrs590977(SEQ ID NO：3)中的至少一者的至少一部分组成的核酸片段群组接触；

(c)确定来自所述样品的核酸是否显示具有连锁不平衡(LD)的单核苷酸多态性(SNP)；以及

(d)根据步骤(c)中得出的结论预测治疗对TNF-介导的疾病的适用性。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述治疗为抗TNF剂。

3.根据权利要求2所述的方法，其中所述抗TNF剂为戈利木单抗。

4.根据权利要求2所述的方法，其中所述抗TNF剂为英夫利昔单抗、阿达木单抗或依那西普。

5.根据权利要求2所述的方法，其中所述TNF介导的疾病为重度或持续性哮喘。

6.根据权利要求1所述的方法，其中将所述样品中观察到的连锁不平衡程度与至少一种参照标准品相比较。

7.根据权利要求6所述的方法，其中所述参照标准品来自未经治疗的重度或持续性哮喘受试者、可响应治疗的受试者或对治疗不响应的受试者的肺活检、面颊拭子、外周血细胞。

8.根据权利要求1所述的方法，其中所述基因群组为核酸片段的阵列。

9.根据权利要求1所述的方法，其中所述样本包括获自正接受治疗的患者的外周血细胞。

10.根据权利要求1所述的方法，其中所述样本在所述治疗开始后一周、四周或八周获得。

11.根据权利要求1所述的方法，其中存在于所述样品中的至少一种核酸的连锁不平衡指示治疗的适用性。

12.根据权利要求1所述的方法，其中步骤(c)包括相对于参照标准品对所述样品进行评估，以确定存在于所述样品中的核酸的连锁不平衡程度。

13.根据权利要求6所述的方法，其中所述参照标准品取自实施疗法前的患者、用安慰剂治疗过的患有TNF介导的相关疾病的患者或来自生物库的样品。

14.根据权利要求1所述的方法，其中来自所述基因群组的至少一个成员选自细胞因子、趋化因子、参与胞外基质重塑的蛋白质、血管生成相关的生长因子、细胞粘附分子和髓过氧化物酶的基因。

15.根据权利要求1所述的方法，其中所述样本包含取自所述受试者的外周血细胞。

16.根据权利要求1所述的方法，其中所述样本为疑似患有重度或持续性哮喘的患者或诊断患有重度或持续性哮喘而未经历治疗的患者的组织活检。

17.根据权利要求1所述的方法，其中所述样本取自实施疗法前的患者、用安慰剂治疗过的患有相似疾病或病症的患者或来自生物库的样品。

18.根据权利要求1所述的方法，其中步骤(b)还包括使所述样品在温和条件、严格条件或极严格条件下暴露于所述核酸片段群组。

19.根据权利要求1所述的方法，其中步骤(c)还包括确定来自所述样品的核酸是否表现出与TNFRSF1A SNP rs4149581(SEQ ID NO：1)、TNFRSF1B SNP rs3766730(SEQ ID NO：2)或TNFRSF1B SNP rs590977(SEQ ID NO：3)中的至少一者连锁不平衡(LD)的单核苷酸多态性(SNP)。

20.一种用于预后或诊断用途的试剂盒，所述试剂盒包括：与标记基因的核苷酸序列相同或互补的寡核苷酸或其互补链，以及表达所述标记基因的细胞，其中所述标记基因是如下基因中的至少一者：TNFRSF1A SNP rs4149581(SEQ ID NO：1)、TNFRSF1B SNPrs3766730(SEQ ID NO：2)或TNFRSF1B SNP rs590977(SEQ IDNO：3)。

21.根据权利要求20所述的试剂盒，其中所述试剂盒适于筛选治疗剂对重度或持续性哮喘的适用性。