[发明专利]稳定化的核酸暗猝灭剂-荧光团探针有效

专利信息
申请号: 200980118821.2 申请日: 2009-04-01
公开(公告)号: CN102037144A 公开(公告)日: 2011-04-27
发明(设计)人: R·M·库克;M·赖特勒 申请(专利权)人: 生物检索技术股份有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C07H21/04
代理公司: 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 代理人: 李瑛
地址: 美国加*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 稳定 核酸 暗猝灭剂 荧光 探针
【权利要求书】:

1.具有根据式I的结构的化合物:

其中

Xa是选自下述的稳定化部分:氟代烷基、取代的或未取代的芳基和取代的或未取代的杂芳基;

L1、L2、L3和L4是独立地选自下述的连接物:取代的或未取代的烷基和取代的或未取代的杂烷基;

Ya是选自CRa和N的成员,

其中

Ra是选自下述的成员:H、取代的或未取代的烷基和取代的或未取代的杂烷基;

Za是选自下述的成员:固体载体、ORb和NRbRb′

其中

Rb和Rb′独立地选自H、取代的或未取代的烷基和取代的或未取代的杂烷基;

Q是荧光能量的猝灭剂,其包括选自下述的成员:

(a)至少3个残基,每个残基独立地选自:取代的或未取代的芳基,和取代的或未取代的杂芳基,其中第一个所述残基通过第一个环外重氮键共价连接至第二个所述残基,且选自所述第一个残基和所述第二个残基的成员通过第二个重氮键共价连接至第三个残基;和

(b)至少2个残基,每个残基独立地选自:取代的或未取代的芳基,和取代的或未取代的杂芳基,其中所述残基中的至少2个通过环外重氮键共价连接,条件是,至少一个所述残基是选自下述的成员:取代的或未取代的多环芳基和取代的或未取代的多环杂芳基;

Rc是选自下述的成员:H、取代的或未取代的烷基、取代的或未取代的杂烷基、取代的或未取代的芳基、取代的或未取代的杂芳基和共价结合核酸的含有磷的连接物。

2.根据权利要求1的化合物,其中Rb是氟代烷基,且Rc是共价结合核酸的含有磷的连接物。

3.根据权利要求1的化合物,其中所述猝灭剂具有根据式(II)的结构

其中

R1、R2和R3是独立地选自下述的成员:取代的或未取代的芳基,和取代的或未取代的杂芳基;

X、Y和Y′是独立地选自下述的成员:反应官能团和使所述猝灭剂共价连接至L3的连接片段,条件是,X、Y和Y′中的至少一个是所述连接片段;

f是0-4的整数,使得当(f x s)大于1时,Y′基团是相同的或不同的;

m是0-5的整数,使得当m大于1时,X基团是相同的或不同的;

n是0-6的整数,使得当(n x t)大于1时,Y基团是相同的或不同的;

s是0-6的整数,使得当s大于1时,R3基团是相同的或不同的;且

t是1-6的整数,使得当t大于1时,R2基团是相同的或不同的,

且当t是1、且s是0时,选自R1、R2及其组合的成员是选自下述的成员:取代的或未取代的多环芳基和取代的或未取代的多环杂芳基。

4.根据权利要求3的化合物,其中所述猝灭剂具有根据式(III)的结构:

5.根据权利要求3的化合物,其中选自R1、R2和R3的成员包括根据式IV的结构:

其中

R4是选自下述的成员:烷基、取代的烷基、芳基、取代的芳基、杂芳基和取代的杂芳基。

6.根据权利要求3的化合物,其中所述猝灭剂具有根据式V的结构:

其中

v是1-10的整数。

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