[发明专利]宛氏拟青霉的检测方法

权利要求书

1.一种宛氏拟青霉(Paecilomyces variotii)的检测方法，其特征在于，

使用由下述(a)或(b)的碱基序列表示的核酸来进行宛氏拟青霉(Paecilomyces variotii)的鉴定，

(a)序列号1～4和22～33中任意一个所记载的β-微管蛋白基因的部分碱基序列或其互补序列，

(b)由序列号1～4和22～33中任意一个所记载的碱基序列中的1个或多个碱基缺失、置换或附加而成的并且能够用于宛氏拟青霉检测的碱基序列或其互补序列。

2.如权利要求1所述的检测方法，其特征在于，

为了进行鉴定，确定被检测菌的β-微管蛋白基因区域的碱基序列，确认该区域的碱基序列中是否含有所述(a)或(b)的碱基序列。

3.如权利要求1或2所述的检测方法，其特征在于，

为了进行鉴定，对所述(a)或(b)的碱基序列的全部或一部分进行扩增，确认有无扩增产物。

4.如权利要求3所述的检测方法，其中，

通过聚合酶链反应(PCR)法来进行所述扩增反应。

5.如权利要求4所述的检测方法，其特征在于，

将能够与以下区域杂交的寡核苷酸用作核酸引物进行基因扩增反应，所述区域是由所述(a)或(b)中记载的碱基序列表示的核酸中的区域并且满足下述4个条件(1)～(4)：

(1)含有宛氏拟青霉(Paecilomyces variotii)所固有的基因的碱基序列以大约10个碱基连续出现的区域，

(2)寡核苷酸的GC含量为30％～80％，

(3)寡核苷酸的自退火的可能性低，

(4)寡核苷酸的Tm值为55～65℃。

6.如权利要求4或5所述的检测方法，其中，

将下述(c)和(d)的寡核苷酸、或者下述(e)的寡核苷酸以及(f)的寡核苷酸和/或(g)的寡核苷酸用作核酸引物，进行所述聚合酶链反应(PCR)法，

(c)由序列号5中记载的碱基序列表示的寡核苷酸、或者由与该碱基序列具有70％以上的同源性并且能够作为核酸引物使用的碱基序列表示的寡核苷酸，

(d)由序列号6中记载的碱基序列表示的寡核苷酸、或者由与该碱基序列具有70％以上的同源性并且能够作为核酸引物使用的碱基序列表示的寡核苷酸，

(e)由序列号7中记载的碱基序列表示的寡核苷酸、或者由与该碱基序列具有70％以上的同源性并且能够作为核酸引物使用的碱基序列表示的寡核苷酸，

(f)由序列号8中记载的碱基序列表示的寡核苷酸、或者由与该碱基序列具有70％以上的同源性并且能够作为核酸引物使用的碱基序列表示的寡核苷酸，

(g)由序列号9中记载的碱基序列表示的寡核苷酸、或者由与该碱基序列具有70％以上的同源性并且能够作为核酸引物使用的碱基序列表示的寡核苷酸。

7.如权利要求3所述的检测方法，其中，

通过环介导等温扩增(LAMP)法来进行所述扩增反应。

8.如权利要求7所述的检测方法，其中，

使用引物组，所述引物组含有由序列号10～13或序列号16～19中记载的碱基序列表示的寡核苷酸。

9.如权利要求7所述的检测方法，其中，

使用含有由序列号10～13中记载的碱基序列表示的寡核苷酸的引物组，还使用由序列号14中记载的碱基序列表示的寡核苷酸组成的引物和/或由序列号15中记载的碱基序列表示的寡核苷酸组成的引物。

10.如权利要求7所述的检测方法，其中，

使用由序列号16～19中记载的碱基序列表示的寡核苷酸组成的引物组，还使用由序列号20中记载的碱基序列表示的寡核苷酸组成的引物和/或由序列号21中记载的碱基序列表示的寡核苷酸组成的引物。

11.一种用于宛氏拟青霉(Paecilomyces variotii)检测的DNA，由下述(a)或(b)的碱基序列表示：

(a)序列号1～4和22～33中任意一个所记载的β-微管蛋白基因的部分碱基序列或其互补序列，

(b)由序列号1～4和22～33中任意一个所记载的碱基序列中的1个或多个碱基缺失、置换或附加而成的并且能够用于宛氏拟青霉检测的碱基序列或其互补序列。