[发明专利]HIV-1感染的人辅因子的全基因组目视鉴定

说明书

本发明涉及在HIV感染的早期阶段中所牵涉的人宿主因子的鉴定。此外，本发明涉及所鉴定的基因用于阐明HIV感染的机制、作为药物靶标和用于鉴定在治疗HIV中有用的化合物的用途。

发明背景

大多数慢性疾病和感染在细胞的整体水平上显现。通过活细胞成像来检查疾病进展允许达到高的分辨率程度，其中使得分子疾病机制和其对遗传变化的响应可视化。尽管该类型的方法在独个实验中是非常成功的，但对于系统性的全基因组分析来说在很大程度上仍是难以适用的。

在进化过程中，HIV学会了将其生活周期的大部分分包给人宿主因子。在最近十年中，已通过多种方法鉴定了几种此类宿主因子(关于综述，请参见¹)。没有几种在鉴定宿主因子中的方法是系统性的，并且迄今没有一种方法是彻底的。但是，宿主因子的可得并不只对于充分理解HIV生活周期是重要的。探寻病毒宿主因子的有效方法将进一步允许将HIV亚型的因子特异性相互地或与SIV(猿猴免疫缺陷病毒)进行比较，从而指出感染表现中的关键机制，和潜在的治疗靶标。

本发明的目标是，鉴定在HIV感染的早期阶段中所牵涉的人宿主因子，其用于阐明HIV感染的机制、作为药物靶标和用于鉴定在治疗HIV中有用的化合物。

发明描述

本发明的目标通过下述技术方案而得到实现：具有由SEQ ID No.46所表示的序列的核酸，或其部分序列，或与所述核酸或所述部分序列互补的序列，其中所述部分序列包含至少20个连续核苷酸，它们用于

a)阐明HIV感染的机制；

b)作为药物靶标；或者

c)鉴定在治疗HIV中有用的化合物。

本发明的目标还通过下述技术方案而得到实现：具有由SEQ ID No.1或SEQ ID No.2所表示的序列的核酸，或其部分序列，或与所述核酸或所述部分序列互补的序列，其中所述部分序列包含至少20个连续核苷酸，它们用于

a)阐明HIV感染的机制；

b)作为药物靶标；或者

c)鉴定在治疗HIV中有用的化合物。

本发明的目标还通过下述技术方案而得到实现：具有由SEQ ID No.5所表示的序列的核酸，或其部分序列，或与所述核酸或所述部分序列互补的序列，其中所述部分序列包含至少20个连续核苷酸，它们用于

a)阐明HIV感染的机制；

b)作为药物靶标；或者

c)鉴定在治疗HIV中有用的化合物。

本发明的目标还通过下述技术方案而得到实现：具有由SEQ ID No.3-4和6-45中任一个所表示的序列的核酸，或其部分序列，或与所述核酸或所述部分序列互补的序列，其中所述部分序列包含至少20个连续核苷酸，它们用于

a)阐明HIV感染的机制；

b)作为药物靶标；或者

c)鉴定在治疗HIV中有用的化合物。

如在本文中所使用的，术语“核酸”意指脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)。

如在本文中所使用的，术语“与所述核酸或所述部分序列互补的序列”还指相应的(互补的)RNA序列或部分序列。

所述部分序列的20个连续核苷酸的最小长度确保了它们的特异性。在一个优选的实施方案中，所述部分序列包含至少21个连续核苷酸，和在一个更加优选的实施方案中，所述部分序列包含至少22个连续核苷酸。

如在本文中所使用的，术语“药物”意指适合用于治疗HIV的药物学试剂。

抑制(a)与靶蛋白的结合、(b)靶蛋白的活性或者(c)靶蛋白的表达的化合物的最初鉴定可以通过实验来达到，或者可以基于关于靶标的可用信息。抑制(a)和(b)的化合物在蛋白质水平上起作用。抑制(c)的化合物针对编码蛋白质或具有调控功能的核酸(例如DNA，RNA，mRNA)。可以使用诸如竞争性和非竞争性结合测定法的技术来测定化合物结合蛋白质的能力。此类测定法可以例如使用经标记的化合物(直接测量)或与各自化合物相结合的可检测试剂(间接测量)来进行。经鉴定的靶蛋白的编码性核酸序列(例如由SEQ ID No.1至46，优选地SEQ ID No.46、1-2或5所表示的基因/核酸)为能够与所述核酸杂交的化合物提供了靶标。此类化合物的例子包括siRNAs、核酶和反义核酸。