[发明专利]用于核酸测序验证、校准和标准化的方法和系统

权利要求书

1.一种用于进行核酸样品测序的质量控制的系统，所述系统包含：

固体支持物的集合，每个固体支持物具有与其相连的多个核酸序列，

其中所述集合包含多组固体支持物，且每组含有具有与其相连的相同核酸序列的固体支持物，

其中每组的核酸序列彼此不同，且

其中所述核酸序列被合成地衍生。

2.权利要求1的系统，其中所述固体支持物是珠子。

3.权利要求1的系统，其中所述多个核酸序列通过模板核酸序列的聚合酶链式反应连接到每个固体支持物上。

4.权利要求1的系统，其中所述多个核酸序列化学地或生化地连接到每个固体支持物上。

5.权利要求1的系统，其中设计每个核酸序列，使得在通过连接测序的过程中的连续连接循环不会产生与染料-标记的探针核酸序列相同的检出颜色。

6.权利要求1的系统，其中所述集合包含至少64组固体支持物。

7.权利要求6的系统，其中所述集合包含至少1024组固体支持物。

8.权利要求1的系统，其中每个固体支持物具有与其相连的约5,000至约250,000个单克隆核酸序列。

9.权利要求1的系统，其中每个核酸序列包含多个标签序列，其中所述多个标签序列包含相同的序列或不同的序列。

10.权利要求9的系统，其中在所述多个标签序列的每一个之间安置内部接头序列。

11.权利要求1的系统，其中所述连接到固体支持物上的核酸序列是单克隆核酸序列。

12.权利要求1的系统，其中设计所述核酸序列，使得每个序列的折叠自由能最小化。

13.权利要求1的系统，其中设计所述核酸序列，使得一行中的任意x个碱基的序列不在间隔nx距离处的一行中的另一系列x个碱基的核酸序列中重复，其中n是正整数，且x是在通过连接测序的过程中在每个连接循环中被探针序列覆盖的碱基的数目。

14.一种为进行核酸样品测序准备质量控制的方法，所述方法包括：

产生多个合成核酸序列，其中每个合成核酸序列不同于另一核酸序列；

将所述合成核酸序列中每一个连接到在多组固体支持物中的固体支持物上，其中每组中的固体支持物具有与其相连的相同的合成核酸序列；并

将每组的固体支持物与所述连接的合成核酸序列相组合，以产生用于进行核酸样品测序的固体支持物的控制集合。

15.权利要求14的方法，其中产生多个合成核酸序列包括产生序列，使得所述序列的一行中的任意x个碱基不在间隔nx距离处的一行中的另一系列x个碱基的核酸序列中重复，其中n是正整数，且x是在通过连接测序的过程中在每个连接循环中被探针序列覆盖的碱基的数目。

16.权利要求14的方法，其另外包括：扩增在每个固体支持物上的合成核酸序列，使得每个固体支持物具有与其相连的合成核酸序列的多个单克隆拷贝。

17.权利要求16的方法，其中所述扩增包括：在与其它合成核酸序列分开的反应中扩增每个合成核酸序列。

18.权利要求14的方法，其中每个固体支持物具有约5,000个至约250,000个与其相连的合成核酸序列。

19.权利要求14的方法，其中将所述合成核酸序列中的每一个连接到固体支持物上包括：化学地或生化地将所述合成核酸序列连接到所述固体支持物上。

20.权利要求14的方法，其中所述固体支持物是珠子。

21.权利要求14的方法，其中设计每个合成核酸序列，使得在通过连接测序的过程中的连续连接循环不会产生与染料-标记的探针核酸序列相同的检出颜色。

22.权利要求14的方法，其中所述固体支持物的组合的组包含至少64组固体支持物。

23.权利要求22的方法，其中所述固体支持物的组合的组包含至少1024组固体支持物。

24.权利要求14的方法，其中每个核酸序列包含多个标签序列，其中所述多个标签序列包含相同的序列或不同的序列。