[发明专利]检测碱基的孔无效
申请号: | 200980134863.5 | 申请日: | 2009-07-06 |
公开(公告)号: | CN102144037A | 公开(公告)日: | 2011-08-03 |
发明(设计)人: | J·克拉克;L·贾雅辛格;T·里德;H·贝利 | 申请(专利权)人: | 牛津纳米孔技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京北翔知识产权代理有限公司 11285 | 代理人: | 张广育;姜建成 |
地址: | 英国*** | 国省代码: | 英国;GB |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 碱基 | ||
1.一种用于检测样品中一个或多个核苷酸的突变体α-溶血素(α-HL)孔,所述突变体α-溶血素包括:
(a)每个均包含SEQ ID NO:2中所示序列或其变体的7个亚基;和
(b)对所述孔和所述核苷酸之间的相互作用有利的分子衔接体,
其中所述7个亚基中的一个或多个在SEQ ID NO:2的残基139处和/或附近被修改,以有利于所述衔接体的定位,并且
其中所述分子衔接体共价结合于一个或多个所述亚基,使得它位于SEQ ID NO:2的残基139处或附近。
2.权利要求1的突变体α-HL孔,其中所述7个亚基的一个或多个在SEQ ID NO:2的残基139处和/或附近包含谷氨酰胺。
3.权利要求2的突变体α-HL孔,其中所有所述7个亚基在SEQ IDNO:2的残基139处和/或附近包含谷氨酰胺。
4.权利要求2或3的突变体α-HL孔,其中所述7个亚基的一个或多个在SEQ ID NO:2的残基136、137、138、139、140、141和142的一个或多个处包含谷氨酰胺。
5.前述权利要求任一项的突变体α-HL孔,其中所述衔接体共价结合于一个或多个所述亚基中的SEQ ID NO:2的残基119、121或135。
6.权利要求5的突变体α-HL孔,其中一个或多个所述亚基中的残基119、121或135被修改,以有利于所述衔接体的共价结合。
7.权利要求6的突变体α-HL孔,其中通过引入半胱氨酸对残基119、121或135进行修改。
8.前述权利要求任一项的突变体α-HL孔,其中还将所述7个亚基的一个或多个进行进一步修改,以有利于所述衔接体的共价结合。
9.权利要求8的突变体α-HL孔,其中通过在SEQ ID NO:2的残基113处引入精氨酸对所述一个或多个亚基进行修改。
10.前述权利要求任一项的突变体α-HL孔,其中所述孔包含:
(a)6个SEQ ID NO:8所示的α-HL M113R/N139Q的亚基和1个SEQ ID NO:14所示的α-HL M113R/N139Q/L135C-D8的亚基;
(b)6个SEQ ID NO:8所示的α-HL M113R/N139Q的亚基和1个SEQ ID NO:10所示的α-HL M113R/N139Q/G119C-D8的亚基;或者
(c)6个SEQ ID NO:8所示的α-HL M113R/N139Q的亚基和1个SEQ ID NO:12所示的α-HL M113R/N139Q/N121C-D8的亚基。
11.前述权利要求任一项的突变体α-HL孔,其中所述分子衔接体是环糊精。
12.权利要求11的突变体α-HL孔,其中所述环糊精是七-6-氨基-β-环糊精(am7β-CD)。
13.前述权利要求任一项的突变体α-HL孔,其中所述衔接体经双功能的交联剂共价结合于所述孔。
14.一种多核苷酸序列,所述多核苷酸序列编码具有SEQ ID NO:2所示序列或其变体的α-HL的亚基,其中所述亚基在SEQ ID NO:2的残基119、121或135处具有半胱氨酸。
15.权利要求14的多核苷酸序列,其中所述多核苷酸包含SEQ IDNO:9、11或13所示的序列。
16.一种用于产生突变体α-HL孔的试剂盒,包含均编码具有SEQ IDNO:2所示序列或其变体的α-HL的亚基的7个多核苷酸,其中所述亚基中的至少一个在SEQ ID NO:2的残基119、121或135处具有半胱氨酸。
17.权利要求16的试剂盒,其中所述试剂盒包含:
(a)6个包含SEQ ID NO:7所示序列的多核苷酸;以及
(b)1个包含SEQ ID NO:9、11或13所示序列的多核苷酸。
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