[发明专利]前列腺癌的筛查、预后、诊断或治疗反应的预测方法和实施所述方法的装置无效
申请号: | 200980138659.0 | 申请日: | 2009-07-31 |
公开(公告)号: | CN102171698A | 公开(公告)日: | 2011-08-31 |
发明(设计)人: | K·奥里博;J-D·穆勒;G·康塞尔-塔桑;O·屈塞诺;S·加聚;N·吉拉尔迪;D·梅西耶;J-P·波利;E·拉马索;F·叙阿尔 | 申请(专利权)人: | 原子能和能源替代品委员会 |
主分类号: | G06F19/18 | 分类号: | G06F19/18 |
代理公司: | 北京戈程知识产权代理有限公司 11314 | 代理人: | 程伟 |
地址: | 法国*** | 国省代码: | 法国;FR |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 前列腺癌 预后 诊断 治疗 反应 预测 方法 实施 装置 | ||
1.一种前列腺癌的筛查或诊断或治疗处置或预后的个体预测方法,其包括收集个体输入数据(xi),提供与疾病类型相连的风险预测信息(y),其特征在于:
-收集代表性信息,所述代表性信息是患者的遗传信息和/或临床信息结果,以获得所述的个体数据;
-使用数据捕捉方式获得个体数据(xi);
-通过统计学习构建至少一种模型来生成预测工具,该模型的输入变量是所述的代表性信息;
遗传输入信息包括以下之中的至少一个变量或变量组合(所引用的所有核苷酸位置都符合2006年3月组装的“UCSC基因组浏览器”定义的核苷酸位置):
-定义与4号染色体中127602673-128447913区间的SNP rs2174183和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与2号染色体中37855761-38126567区间的SNP rs7576160和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与2号染色体中241767109-242119399区间的SNP rs2012385和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与17号染色体中63815611-64165896区间的SNP rs888298和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与19号染色体中62026584-62294837区间的SNP rs8110935和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与11号染色体中17464539-17757162区间的SNP rs2190453和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与1号染色体210157195-210446272区间的SNP rs2788140和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与1号染色体中149382371-149874970区间的SNP rs3828054和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与3号染色体中116302446-117011700区间的SNP rs1499955和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与3号染色体中69049525-69153397区间的SNP rs4855539和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与7号染色体中27414591-27808301区间的SNP rs11526176和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与11号染色体中99092040-99333419区间的SNP rs7934514和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与1号染色体中236815776-236998150区间的SNP rs6681102和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与15号染色体中38991207-39584443区间的SNP rs6492998和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与2号染色体中113062733-113411386区间的SNP rs2048873和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与2号染色体中12111054-12324507区间的SNP rs4669835和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与18号染色体中23907695-24187878区间的SNP rs12605415和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与4号染色体中39097014-39163238区间的SNP rs749915和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与7号染色体中104002818-104863625区间的SNP rs13226041和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与17号染色体中61335448-62195826区间的SNP rs721429和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与16号染色体中84725899-84776802区间的SNP rs2352946和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与6号染色体中70074721-70679396区间的SNP rs9364048和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与2号染色体中79446556-79664842区间的SNP rs6755695和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与19号染色体中4098195-4506560区间的SNP rs1138253和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与10号染色体中29356293-29651117区间的SNP rs1773842和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与14号染色体中43257771-43665346区间的SNP rs10148742和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量;
-定义与7号染色体中47461234-47557773区间的SNP rs10245886和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量。
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