[发明专利]在载体上固定化核酸的方法有效
申请号: | 200980138951.2 | 申请日: | 2009-09-22 |
公开(公告)号: | CN102171368A | 公开(公告)日: | 2011-08-31 |
发明(设计)人: | A.皮里克;H.R.斯塔珀特 | 申请(专利权)人: | 皇家飞利浦电子股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 李波;刘鹏 |
地址: | 荷兰艾*** | 国省代码: | 荷兰;NL |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 载体 固定 核酸 方法 | ||
1. 一种在载体上固定化核酸的方法,其包括以下步骤:
(a)提供带有仅一种碱基类型的核苷酸段的核酸;及
(b)通过光交联在固体载体上固定化所述核酸,其中所述光交联在约300-500nm的波长下进行,优选在365nm的波长进行。
2. 权利要求1的方法,其中所述核酸是DNA、RNA、PNA、CNA、HNA、LNA或ANA,其寡核苷酸或其任何的组合。
3. 权利要求1或2的方法,其中所述核酸是双链的或单链的。
4. 权利要求1的方法,其中所述仅一种碱基类型的核苷酸段是鸟嘌呤或尿嘧啶段。
5. 权利要求4的方法,其中所述仅一种碱基类型的核苷酸段具有约7到约100个核苷酸的长度,优选约16个核苷酸。
6. 权利要求1的方法,其中所述仅一种碱基类型的核苷酸段定位在所述核酸的3'或5'端。
7. 权利要求1或3-6中任意一项的方法,其中所述核酸由下式表示:
5’-Yn-Xm-Br-Xp-Zq-3’
Y和Z是仅一种碱基类型的核苷酸段,其中Y和Z可以是相同或不同的碱基类型; X是间隔,优选由脱碱基核苷酸组成;B是多于一种碱基类型的序列,以及n、m、r、p 和q是核酸中核苷酸的数量,其中以下情况可以应用:n、m、p、q、r >1; n、m、r > 1 且 p、q = 0; p、q、r >1 且 n、m = 0; n、q、r > 1 且 m、p = 0; n、r > 1 且 m、p、q = 0; q、r > 1 且 n、m、p = 0。
8. 权利要求1的方法,其中所述交联使用能量为从约0.5 Joule/cm2到约10 Joule/cm2范围的量进行。
9. 权利要求1的方法,其中所述固体载体包含胺官能化的基团。
10. 权利要求1或9中的方法,其中所述固体载体包含伯胺或仲胺和/或补骨脂素。
11. 权利要求9或10的方法,其中所述固体载体是多孔基片,优选由尼龙组成,或无孔基片,优选由玻璃、聚- L -赖氨酸涂层材料、硝酸纤维素、聚苯乙烯、环烯烃共聚物(COC)、环烯烃聚合物COP、聚丙烯、聚乙烯或聚碳酸酯组成。
12. 一种根据权利要求1到11的任意一项的方法固定化的核酸的分析方法,包括以下步骤:
a) 所述固定化核酸与至少一种包含与所述固定化核酸的区域互补的片段的多聚核苷酸杂交探针,和至少一种包含携带与所述固定化核酸的区域相比单错配的片段的核酸杂交探针;和/或至少一种包含携带与所述固定化核酸的区域相比双错配的片段的核酸杂交探针,和/或至少一种包含携带更高数量的错配的片段的核酸杂交探针杂交;及
b) 确定由固定化核酸和所述杂交探针形成的杂合体的解链点,其中解链点与存在于核酸杂交探针中的错配的类型和/或数量以及在仅一种碱基类型的核苷酸段中仅一种碱基类型的核苷酸的数量相关。
13. 通过根据权利要求1到11中任意一项的方法可获得的固定化核酸。
14. 根据权利要求1到11中任意一项的方法固定化的核酸用于生产核酸阵列的应用。
15. 一种诊断试剂盒,其包含核酸阵列和对照探针,所述核酸阵列根据权利要求1到11中任意一项的方法被固定化,所述对照探针含有确定量的与至少一条所述的固定化核酸互补的已知的标记核酸。
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