[发明专利]临床样品中的干扰素响应(IRIS)

权利要求书

1.一种可用于在受试者中评估多发性硬化(MS)的治疗功效的阵列，其包含对一个或多个异常调节性基因和一个或多个反调节性基因特异性的多种探针，其中所述异常调节性和反调节性基因展现对引入的干扰素β-1B的响应，由此根据与所述治疗前的基因表达相比时所述治疗后的所述异常调节性或反调节性基因的基因表达变化来评估功效。

2.权利要求1的阵列，其中所述一个或多个异常调节性基因是通过缺口比率分析选择的。

3.权利要求1-2中任一项的阵列，其中所述一个或多个异常调节性基因选自表3中所列的基因。

4.权利要求1-3中任一项的阵列，其中所述一个或多个反调节性基因选自表2中所列的基因。

5.权利要求1-4中任一项的阵列，其还包含从表1中所列的干扰素标志物选择的标准的干扰素标志物。

6.权利要求1-5中任一项的阵列，其进一步包含测定对照标志物。

7.权利要求6的阵列，其中所述测定对照标志物包括内源基因和细胞谱系基因。

8.权利要求7的阵列，其中所述内源基因选自下组：GAPDH和HPRT1。

9.权利要求7的阵列，其中所述细胞谱系基因选自下组：CD3e、CD14、CD19、ITGAX、NCAM、和CD16。

10.权利要求1-9中任一项的阵列，其中所述阵列是低密度微观流体测定板。

11.一种使用权利要求1-10中任一项的阵列在受试者中评估多发性硬化的治疗功效的方法。

12.一种用于评估多发性硬化的治疗功效的方法，包括：

(a)测定一个或多个异常调节性基因和一个或多个反调节性基因的表达水平，其中所述异常调节性和反调节性基因在自用抗MS剂治疗前的患者采集的第一生物学样品中展现对引入的干扰素β-1B的响应；

(b)至少在自用所述抗MS剂的初始治疗后的患者采集的第二生物学样品中测定所述异常调节性基因和反调节性基因的表达水平；并

(c)比较所述异常调节性和反调节性基因在所述第二生物学样品中的表达水平与所述异常调节性和反调节性基因在所述第一生物学样品中的表达水平；

其中与所述第一生物学样品中的所述异常调节性或反调节性基因的表达水平相比，所述第二生物学样品中的所述异常调节性或反调节性基因的表达水平变化指明所述治疗的功效。

13.权利要求12的方法，其中所述异常调节性和反调节性基因的表达水平变化创建与可测量的临床响应诸如MRI、复发率、疾病进展、和失能得分(EDSS)相关联的样式，其中使用统计学方法来确定所述样式。

14.权利要求12的方法，其中所述异常调节性基因选自表3中所列的异常调节性基因。

15.权利要求12的方法，其中所述反调节性基因选自表2中所列的反异常性基因。

16.权利要求12的方法，其中所述生物学样品选自下组：血液、尿、骨髓、和活组织检查样品。

17.一种用于鉴定可用于治疗多发性硬化的化合物的方法，包括：

(a)分析一个或多个异常调节性基因和一个或多个反调节性基因的表达水平，其中所述异常调节性和反调节性基因在用化合物处理前的细胞或组织样品中展现对引入的干扰素β-1B的响应；

(b)分析所述异常调节性和反调节性基因在用所述化合物处理后的细胞或组织样品中的表达水平；

其中所述异常调节性和反调节性基因的表达水平的变化指示药物功效。