[发明专利]评价RNA图案的方法

权利要求书

1.一种表征前列腺癌的方法，包括：

(a)确定对象的生物样品中的一种或多种miRNA的表达水平，以及

(b)由所述对象的生物样品确定PCA3评分，

其中所述的PCA3评分是PCA3的表达水平与PSA的表达水平之间的比值；以及

(c)基于所述miRNA和PCA3评分中的至少亚组表征所述前列腺癌。

2.权利要求1所述的方法，其中在步骤(a)和(b)中使用单独的生物样品。

3.权利要求1所述的方法，其中通过下列步骤表征所述的前列腺癌：当所述的miRNA水平低于约3000拷贝/微升并且所述的PCA3评分小于约35时，将所述癌症分类为良性癌。

4.权利要求1所述的方法，其中通过下列步骤表征所述的前列腺癌：当所述的miRNA水平大于约9000拷贝/微升并且所述的PCA3评分大于约35时，将所述的癌症分类为恶性癌。

5.一种表征对象内的癌症的方法，包括：

(a)确定所述对象的生物样品中的多种miRNA中的每一种的表达水平，以及

(b)基于所述的多种miRNA的每一种的所述表达水平表征所述癌症，

其中与通过检测少于所述多种miRNA中的每一种的表达水平所进行的表征相比，步骤(b)中的表征具有增加的灵敏度或特异度。

6.权利要求5所述的方法，其中所述的多种包括至少10种miRNA。

7.权利要求5所述的方法，其中所述的多种miRNA中的至少亚组选自表1。

8.权利要求5所述的方法，其中所述多种miRNA中的至少亚组选自由下列组成的组：miR-629、miR-671-3p、miR-9、miR-491、miR-182、miR125a-3p、miR-324-5p、miR-148b、miR-222、miR-141、miR-99、miR-101、miR-130、miR-135、miR-148、miR-182、miR-186、miR-206、miR-320、miR-374、miR-433、miR-496、miR-517、miR-590、miR-620、miR-768、miR-223、miR-203、miR-199、miR-519、miR-302、miR-30、miR-20、miR-200、miR-23、miR-29、miR-181、miR-548和miR-370。

9.一种将癌症分类为良性癌的方法，包括：

(a)确定对象的生物样品中的一种或多种miRNA的表达水平，以及

(b)当在所述样品中检测出少于约3000拷贝/微升的所述miRNA中的至少亚组时，将所述癌症分类为良性癌。

10.一种将癌症分类为恶性癌的方法，包括：

(a)确定对象的生物样品中的一种或多种miRNA的表达水平，以及

(b)当在所述样品中检测出大于约9000拷贝/微升的所述miRNA中的至少亚组时，将所述癌症分类为恶性癌。

11.权利要求9或10所述的方法，还包括基于所述的分类将选择疗法或治疗方案。

12.权利要求9或10所述的方法，其中将所述分类的结果通过网络传输。

13.一种表征癌症的方法，包括：

确定所述对象的第一生物样品中的一种或多种miRNA的表达水平，

其中如果在所述样品中检测出约1000至约4500拷贝/微升的所述miRNA中的至少亚组，则获取第二生物样品。

14.权利要求13所述的方法，其中所述第一生物样品选自由异质细胞样品、痰、血液、血细胞、血清、活组织、尿、腹膜液和胸膜液所组成的组。

15.权利要求13所述的方法，其中所述第一生物样品不是活组织。

16.权利要求13所述的方法，其中所述第二生物样品是活组织。

17.权利要求13所述的方法，其中通过免疫组织化学、原位杂交(如荧光原位杂交)、PCR、实时PCR、微阵列分析或测序来分析所述第二生物样品。

18.权利要求5、9、10或13所述的方法，其中所述癌症为上皮癌。