[发明专利]同质量氨基酸和其它物质的区分

说明书

技术领域

本发明大体上涉及区分同质量物质(isobaric species)。在一些实施方式中，区分同质量氨基酸。

背景技术

拆分和混合(split-and-mix)合成方法已被用于制备小珠上的肽文库，其中每个珠包含单一的肽分子。此类文库被称为一珠一化合物(one-bead-one-compound，OBOC)的文库。OBOC文库通常被用于从文库中鉴定发挥一些目的功能的分子。例如，通过筛选文库中与特定蛋白连接的珠(“命中”珠(“hit”beads))，可使用OBOC文库来鉴定与所述蛋白结合的分子(即肽)。命中珠可与其余文库分离，且可使用肽测序方法来确定特定命中珠上肽的身份。

由于存在无法通过质谱区分的相似质量的氨基酸(即同质量氨基酸(isobaric amino acid))，所以使用质谱的肽测序很复杂。因此，需要有区分同质量氨基酸的方法。

发明内容

本发明大体上涉及区分同质量物质的方法。在一些实施方式中，区分同质量氨基酸。在一些实例中，本发明的主题涉及相关产品、对特定问题的可选方案、和/或一种或多种系统和/或制品的多种不同应用。

一方面，本发明涉及方法。在一组实施方式中，所述方法包括在表面上生长多个氨基酸序列的步骤。在一些实例中，所述氨基酸序列中的至少一个氨基酸为同质量氨基酸。在某些实施方式中，当将同质量氨基酸加入至暴露于待添加氨基酸的序列的介质中时，含有同质量氨基酸的介质还含有可掺入氨基酸序列中的实体，所述实体具有不同于所述同质量氨基酸的分子量。

在另一组实施方式中，所述方法包括使用质谱来区分第一氨基酸序列和与所述第一序列具有相同数目氨基酸残基的第二氨基酸序列。在一些实施方式中，除了在一个或多个位置处第一氨基酸序列含有第一同质量氨基酸外，第二氨基酸序列与第一氨基酸序列相同。在一些实例中，第二氨基酸序列含有具有与第一氨基酸不同的分子量的第二氨基酸。

根据本发明的另一组实施方式，所述方法包括将连接表面的氨基酸序列暴露于含有同质量氨基酸的溶液。在一些实施方式中，所述同质量氨基酸是由第一氨基酸物质和第二氨基酸物质组成的同质量组(isobaric group)的成员。在某些实例中，当掺入氨基酸序列中的同质量氨基酸为第一氨基酸物质时，溶液还包含可掺入氨基酸序列中的实体，所述实体具有不同于所述同质量氨基酸的分子量。在一些实例中，当加入氨基酸序列中的同质量氨基酸为第二氨基酸物质时，溶液基本上不含可掺入的实体。

另一方面，本发明涉及组合物。在一组实施方式中，所述组合物包括第一氨基酸序列和与所述第一序列具有相同数目氨基酸残基的第二氨基酸序列。在一些实例中，除了在一个或多个位置处第一氨基酸序列含有第一同质量氨基酸外，第二氨基酸序列与第一氨基酸序列相同。在某些实例中，第二氨基酸序列包含具有与第一氨基酸不同分子量的第二氨基酸。

另一方面，本发明涉及制品。根据一组实施方式，所述制品包含第一氨基酸序列和第二氨基酸序列分别经由可裂解部分连接的表面。在一些实施方式中，第二氨基酸序列与第一序列具有相同数目的氨基酸残基。在某些实例中，除了在一个或多个位置处第一氨基酸序列包含第一同质量氨基酸外，第二氨基酸序列与第一氨基酸序列相同。在一些实例中，第二氨基酸序列包含具有与第一氨基酸不同的分子量的第二氨基酸。

从以下详述的本发明各种非限定实施方式并结合附图可更清楚本发明的其它优点和新特征。当本申请文件和通过援引加入的文献相冲突和/或不一致时，以本申请文件为准。如果通过援引加入的两篇或更多篇文献彼此冲突和/或不一致时，以有效日在后的文献为准。

附图说明

本发明的非限制性实施方式通过实施例和参考附图来说明，附图为示意图，而并非按比例绘制。在附图中，每个相同或相近的要素通常用同一个附图标记表示。为了清楚说明，未将所有要素标记在每个图中，也未标记本发明每个实施方式的每个要素，这些说明对本领域普通技术人员理解本发明不是必须的。在附图中：

图1A显示了根据本发明实施方式的分析方法；

图1B显示了根据本发明另一实施方式的分析方法；

图1C显示了根据本发明一个实施方式的逻辑树分析流程图；

图2显示了根据本发明另一实施方式的测序流程图；

图3显示了根据本发明实施方式的命中肽和相应母峰质量的表；

图4A显示了根据本发明另一实施方式的包含同质量氨基酸的命中肽的质谱；