[发明专利]一种PCR荧光分子信标探针技术定量检测人类白细胞抗原B27基因的方法无效
申请号: | 201010001567.2 | 申请日: | 2010-01-04 |
公开(公告)号: | CN102115784A | 公开(公告)日: | 2011-07-06 |
发明(设计)人: | 王虹 | 申请(专利权)人: | 王虹 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 510663 广东省广州市萝岗区高新技术产*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 pcr 荧光 分子 信标 探针 技术 定量 检测 人类 白细胞 抗原 b27 基因 方法 | ||
1.一种以人类白细胞抗原B27(HLA-B27)基因为检测目标的PCR荧光分子信标探针定量检测技术,包括以下步骤:
a、在HLA-B27基因中选择一段小于150bp的片段做为靶序列,合成一对引物;
b、根据靶序列中位于两个引物之间的序列,设计合成一个荧光分子信标探针,其淬灭基团为DABCYL,荧光基团为FAM;
c、构建一个引物与靶序列完全相同、片段长度与靶序列长度相似,但序列内容与靶序列不同的内参标准品。并根据内参标准品的序列,设计合成一个荧光分子信标探针,其淬灭基团为DABCYL,荧光基团为ROX。
d、提取待测标本中的DNA,使用步骤a中的引物、步骤b中的探针、步骤c中的内参标准品及其探针,与其它PCR反应体系成分混合,进行PCR反应,扩增靶基因片段和内参标准品片段。
e、分别检测反应结束后的FAM和ROX荧光值,根据各自外标曲线计算靶序列和内参标准品的反应终拷贝数。
f、根据内参标准品的起始拷贝数和反应终拷贝数计算PCR扩增效率,根据靶序列的终拷贝数和PCR扩增效率计算靶序列的起始拷贝数。
2.权利要求1所述的PCR荧光分子信标探针定量检测技术,其特征在于所述的待测核酸为人类白细胞抗原B27基因第5外显子及其前后DNA序列共142bp。
所述的特异性核酸序列(Seq 1)为:
1 TTCCCTTCCT TTCCCAGAGC CGTCTTCCCA GTCCACCGTC CCCATCGTGG
51 GCATTGTTGC TGGCCTGGCT GTCCTAGCAG TTGTGGTCAT CGGAGCTGTG
101 GTCGCTGCTG TGATGTGTAG GAGGAAGAGC TCAGGTAGGG AA
所述的引物序列为:
引物1(Seq 2):5’TTC CCT TCC TTT CCC AGA G 3’
引物2(Seq 3):5’TTC CCTACC TGAGCT CTT CCT 3’
所述的荧光分子信标探针序列(Seq 4)为:
5’CAG GCT CGT TGT GGT CAT CGG AGC TGT GGT GAG CCT G 3’
3.权利要求1.c所述的内参标准品,其特征在于所述的核酸为人类β-Actin基因第4外显子部分DNA序列与权力要求2所述的引物序列构建的片段,共142bp。
所述的内参标准品核酸序列(Seq 5)为:
1 TTCCCTTCCT TTCCCAGAGC GTACCACTGG CATCGTGATG GACTCCGGTG
51 ACGGGGTCAC CCACACTGTG CCCATCTACG AGGGGTATGC CCTCCCCCAT
101 GCCATCCTGC GTCTGGACCT GAGGAAGAGC TCAGGTAGGG AA
所述的内参标准品荧光分子信标探针序列(Seq 6)为:
5’CAG GCT CCC CAC ACT GTG CCC ATC TAC GAG AGC CTG 3’
4.权利要求1所述的PCR荧光分子信标探针定量检测技术在血细胞、组织细胞、人体液中脱落细胞等各种样本的检测。
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