[发明专利]一种同时检测32个单核苷酸多态性位点基因型的方法无效
申请号: | 201010100715.6 | 申请日: | 2010-01-26 |
公开(公告)号: | CN101851672A | 公开(公告)日: | 2010-10-06 |
发明(设计)人: | 田亚平;张阳东 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军总医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京君智知识产权代理事务所 11305 | 代理人: | 郑明 |
地址: | 100853*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 同时 检测 32 核苷酸 多态性 基因型 方法 | ||
1.一种同时检测32个单核苷酸多态性位点的方法,这些基因及32个标签单核苷酸多态性位点是内收蛋白1基因:rs3775067、rs1263359,血小板内皮细胞黏附分子-1基因:rs503550,C-反应蛋白基因:rs1205,内皮固有型一氧化氮合酶基因:rs7830、rs3918188,浆细胞膜糖蛋白1基因:rs12528076、rs858341、rs021966、rs858345、rs9308995,L-选择素基因:rs964555、rs2205848、rs4987318、rs2298900,G蛋白β3亚单位基因:rs5445,血管紧张素I转换酶基因:rs4333、rs4305、rs4353,血管紧张素II 1型受体基因:rs6801836、rs2675511、rs5182,血管紧张素原基因:rs1926722、rs7539020、rs3889728、rs493132、rs478523,亚甲基四氢叶酸还原酶基因:rs1801133、rs9651118、rs6541003和肝脂肪酶基因:rs12462668、rs10426971,其特征在于检测方法包括下述步骤:
(1)设计并合成用于扩增32个单核苷酸多态性位点的序列1至序列96引物,每个单核苷酸多态性设计3个引物,其中2个为PCR扩增引物,用于扩增出含有目的单核苷酸多态性位点的片断;1个为延伸引物,用于单核苷酸多态性位点的测序及与玻璃芯片上的寡核苷酸链杂交;
(2)稀释并混合PCR引物,对目标DNA进行PCR扩增;
(3)对扩增产物进行纯化;
(4)稀释并混合延伸引物,进行延伸反应;
(5)杂交;
(6)对杂交板进行荧光扫描,根据荧光信号判断单核苷酸多态性位点的基因型。
2.根据权利要求1所述的一种同时检测32个单核苷酸多态性位点的方法,其特征在于所述的步骤(2)中将PCR引物稀释并混合使其终浓度为2.5μM,构建PCR引物池,每96人份PCR反应体系为:
试剂成分 体积(μL)
引物池(2.5μL) 11.2
脱氧核苷酸(2.5mM) 20
10倍PCR缓冲液II 56.2
氯化镁(25mM) 112.6
金牌扩增酶(5U/μL) 11.2
双蒸水 126
3.根据权利要求1所述的一种同时检测32个单核苷酸多态性位点的方法,其特征在于所述的步骤(2)中PCR循环条件为:
4.根据权利要求1所述的一种同时检测32个单核苷酸多态性位点的方法,其特征在于所述的步骤(4)中将延伸引物稀释并混合使其终浓度为5μM,构建延伸引物池。每96人份PCR反应体系为:
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