[发明专利]一组能有效下调PRDM1β表达的siRNA分子及其应用有效
申请号: | 201010127886.8 | 申请日: | 2010-03-18 |
公开(公告)号: | CN102191244A | 公开(公告)日: | 2011-09-21 |
发明(设计)人: | 赵维莅;陈赛娟;张群岭;杨帆 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;A61K48/00;A61P35/02;A61K31/704 |
代理公司: | 上海申蒙商标专利代理有限公司 31214 | 代理人: | 周丰 |
地址: | 200025 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一组 有效 下调 prdm1 表达 sirna 分子 及其 应用 | ||
【技术领域】
本发明涉及一组siRNA分子,具体地说,是关于一组能有效下调PRDM1β表达的siRNA分子及其应用。
【背景技术】
淋巴瘤是原发于淋巴结或结外淋巴组织的恶性肿瘤。在我国,淋巴瘤发病率约为3-4/10万,每年新发患者约4.5万人,死亡人数超过2万人,发病率占男性恶性肿瘤的第9位,占女性恶性肿瘤的第10位。并且发病率呈逐年升高趋势,严重威胁人类健康。
淋巴瘤分为霍奇金淋巴瘤(Hodgkin Lymphoma,HL)和非霍奇金淋巴瘤(Non-Hodgkin Lymphoma,NHL)两大类,其中,以NHL为主,大约占到80-90%。淋巴瘤常采用联合化疗、放疗、免疫靶向治疗及骨髓移植等综合方案治疗。尽管淋巴瘤的治疗取得了很大进步,能使近一半患者长期无病生存,但仍有约半数以上的患者对治疗反应差,预后不理想,影响淋巴瘤预后的因素很多,但主要与病理亚型、分期、国际预后指征(IPI)和病变特殊部位有关。
淋巴瘤是一个高度异质性疾病,平衡易位导致的BCL6,BCL2,c-MYC等基因表达异常,基因扩增,非随机染色体缺失以及异常的体细胞超突变是常见的发病机制,但也有部分患者未发现已知突变。这些发病因素中有些会直接影响淋巴瘤的预后,也有一些因素通过影响下游靶分子的表达,间接影响淋巴瘤的预后。因此,那些在B细胞及T/NK细胞发育、分化、增殖中起关键作用的基因的表达变化,可能对判断淋巴瘤的预后具有重要意义。PRDM1β就是一种与淋巴瘤预后相关的转录因子。
PRDM1(PR domain containing 1,with ZNF domain)是一个含有5个锌指结构的转录抑制因子,又名B淋巴细胞诱导成熟蛋白1(B-lymphocyteinduced maturation protein-1,BLIMP-1)。PRDM1基因定位于人类染色体6q21-q22.1,有两种转录本,即PRDM1α和PRDM1β。
最初人们只认识到PRDM1α,发现它在正常B淋巴细胞中具有重要生理功能,不但能够抑制细胞增殖,也可以促进细胞分化,在B细胞分化为成熟浆细胞中具有重要作用。因此,PRDM1被界定为一种肿瘤抑制基因。随后也有研究-证实,在弥漫大B细胞性淋巴瘤中,约20%左右的患者可以检出PRDM1基因突变,主要是点突变,绝大多数位于第二外显子/第二内含子连接处,导致产生功能缺失或降低的只含有少部分氨基端的截短型PRDM1蛋白。Pasqualucci等的研究还发现,在DLBCL患者中,不仅部分患者存在PRDM1基因突变,且85%以上的患者同时不表达PRDM1蛋白。越来越多的研究表明,大部分DLBCL患者不表达PRDM1蛋白,除基因突变导致的PRDM1表达降低外,表观遗传学因素如DNA甲基化、组蛋白乙酰化等因素可能也参与下调PRDM1表达,导致淋巴瘤发生。
而在研究PRDM1蛋白表达与预后关系时,Garcia等惊奇地发现,PRDM1表达阳性患者的无失败生存率明显低于PRDM1阴性患者,两者之间有统计学差异,提示PRDM1表达可能与淋巴瘤患者预后差有关。这一结论违背了传统意义上人们对PRDM1蛋白的认识,倘若PRDM1是一个肿瘤抑制基因,那么表达PRDM1患者的治疗效果应该比不表达PRDM1的患者好。
进一步的研究才发现,人类PRDM1基因有两种转录本,即PRDM1α和PRDM1β,分别编码由789个氨基酸构成的PRDM1α和由690个氨基酸构成的PRDM1β。PRDM1α蛋白主要由5个结构域构成,即氨基端酸性区、PR结构域、脯氨酸富集区、5个锌指结构和羧基端酸性区。PRDM1β与PRDM1α相比,缺失了氨基端101个氨基酸,包含氨基端酸性区和部分PR结构域。PR结构域在进化上高度保守,与SET结构域高度同源,对于PRDM1α发挥转录抑制作用非常重要,参与蛋白质与蛋白质之间的相互作用及染色质介导的基因表达。PRDM1α通过其PR结构域募集组蛋白去乙酰化酶、Groucho家族蛋白、组蛋白甲基转移酶G9a到其靶基因的启动子区,抑制靶基因的转录。PRDM1α抑制的靶基因主要有c-myc,MHC II类分子反式激活蛋白(MHC class II trans-activator,CIITA),CD23b,B细胞特异性激活蛋白(B cell lineage-specific activator protein,BSAP)/Pax-5,Spi-B和Id3等。
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