[发明专利]一种应用代谢组学技术定量评价药效的方法无效
申请号: | 201010141863.2 | 申请日: | 2010-04-08 |
公开(公告)号: | CN101799462A | 公开(公告)日: | 2010-08-11 |
发明(设计)人: | 王广基;阿基业;刘林生;曹蓓;郑天;石建;李梦婕;龚平;王新文;赵春艳;陆益红;黄青;严蓓;查伟斌;顾胜华;张颖 | 申请(专利权)人: | 中国药科大学 |
主分类号: | G01N30/72 | 分类号: | G01N30/72 |
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地址: | 210009*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 应用 代谢 技术 定量 评价 药效 方法 | ||
1.一种应用代谢组学技术进行药效定量评价的方法所依赖的是仪器测定所得到的代谢组学数据,其特征包括以下几个方面:
a)采用血清作为样本进行检测;
b)采用甲醇沉淀蛋白的方法对血清中小分子进行提取;
c)采用三甲基硅烷基三氟乙酰MSTFA的方法对样本进行衍生化;
d)采用气相色谱-飞行时间质谱(GC/TOF-MS)进行样本分析;
e)应用SIMCA P-11软件和偏最小二乘-判别分析(PLS-DA)建立数学模型;
f)从多维空间数学模型中提取参数,计算用药组和对照组之间相对距离。
2.除权利要求1中血清作为生物样本外,生物样本还可来源于人、动物、细胞、组织等,具体包括全血、血浆、血清、尿液、脑脊液、唾液、泪液、汗液、组织匀浆、细胞或细胞培养液。
3.权利要求2中上述生物样本至少其中一组为用药后采集生物样本(给药组),一组为对照组;对照组可以是给药前自身对照,也可以是未给药的模型组平行对照,还可以是未给药的正常组对照。
4.除权利要求1中甲醇沉淀蛋白的方法处理生物样本外,还包括经过其它蛋白沉淀方法,如加入有机溶剂(如乙醇、丙酮、乙腈、异丙醇)、各种酸碱盐沉淀、微波、加热沉淀的方法;或经过有机溶剂进行液-液提取,有机溶剂包括乙酸乙酯、氯仿、乙醚、正丁醇、石油醚、二氯甲烷、苯、正己烷、环己烷、乙腈;或过滤/超滤的方法;或固相萃取方法;或生物样本不经过前处理的方法。
5.除权利要求1中采用气相色谱-飞行时间质谱(GC/TOF-MS)进行样本分析外,还包括其它任何基于质谱测定技术、核磁共振测定技术和其它代谢组学测定技术的分析方法。
6.权利要求1中所得到的数据可以是绝对定量数据,也可以半定量数据,如峰面积、峰高,或由此采用数学方法计算得到的数据。
7.除权利要求1中应用SIMCA P-11软件和偏最小二乘-判别分析(PLS-DA)建立数学模型的方法外,还包括其它代谢组学数据处理软件,如SPSS、Matlab、SIMCA-P等各类版本;包括选择除偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)外的其它方法,如正交偏最小二乘法(OPLS)、正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA)、主成分分析(PCA)、非线性映射(Nonlinemapping,NLM)、聚类分析(HCA)等方法建立数学模型。
8.权利要求1中的数学模型可以为任意维空间模型,这里的多维空间可以是1、2、3维,也可以是4、5、6甚至更多维空间。
9.权利要求1中用药组和对照组之间相对距离可以有两种计算方式,先取各组样品的坐标平均值,再计算得到;在有自身对照样品时,也可先计算每个样品给药前后变化距离,再取平均值得到。
10.权利要求9中药效表示可以采用药组和对照组之间相对距离,也可以是相对距离的函数计算值,如常有对数值、自然对数值、平方值、平方根值等任何数学计算方式所得结果。
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