[发明专利]对虾传染性皮下及造血组织坏死病的衣壳蛋白基因及病毒样颗粒

说明书

技术领域

本发明涉及一种蛋白基因，尤其是涉及一种对虾传染性皮下及造血组织坏死病的衣壳蛋白基因及病毒样颗粒。

背景技术

对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(infectious hypodermal and hematopoietic necrosisvirus，IHHNV)是世界各地养殖和野生对虾的重要病原之一，是已知最小的对虾病毒，隶属于细小病毒科(Parvoviridae)短浓核症病毒属(Brevidensovirus)。该病毒分布广泛，对细脚滨对虾有较高致病性和死亡率(90％)，对已被广泛养殖的凡纳滨对虾可导致慢性矮小残缺综合症(runt-deformitysy ndrome，RDS)，使生长畸形，造成较大经济损失。IHHNV的病毒粒子直径约22nm，是无囊膜包被的二十面体，其基因组是线性单链DNA，长度为4.1kb，由三个开放阅读框和两末端的非编码序列构成，预计三个ORF分别编码非结构蛋白1(nonstructural protein 1，NS1)，非结构蛋白2(nonstructural protein 2，NS2)和衣壳蛋白(capsid protein，CP)(1、Bonami JR，Trumper B，Mari J，Brehelin M，and Lightner DV.(1990).Purification and characterization of the infectious hypodermal and haematopoieticnecrosis virus of penaeid shrimps.J Gen Virol 71(Pt 11)：2657-2664；2、Shike H，Dhar AK，Burns JC，Shimizu C，Jousset FX，Klimpel KR，and Bergoin M.(2000).Infectioushypodermal and hematopoietic necrosis virus of shrimp is related to mosquitobrevidensoviruses.Virology 277(1)：167-177)。2008年，本申请人对对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(中国福建株)全基因组进行了测定(GenBank Acc.EF633688)(3、吴昊，徐丽美，杨丰.(2000).对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(福建株)基因组的克隆.台湾海峡27：147-151)，此前虽然在中国大陆大部分地区均发现养殖对虾感染IHHNV(4、Yang B，SongXL，Huang J，Shi CY，and Liu L.(2007).Evidence of existence of infectious hypodermaland hematopoietic necrosis virus in penaeid shrimp cultured in China.Vet Microbiol120(1-2)：63-70)，但并未见其基因组序列报道。序列测定显示该病毒基因组全长3833bp，DNAMAN 5.0软件分析发现有三个较大的ORF位于正链DNA中，其中ORF3起始于2521nt，结束于3510nt，编码的蛋白约有329个氨基酸，分子量为37kDa，预测其产物为衣壳蛋白。