[发明专利]BRAF基因突变检测特异性引物和液相芯片有效
申请号: | 201010160760.0 | 申请日: | 2010-04-23 |
公开(公告)号: | CN102234684A | 公开(公告)日: | 2011-11-09 |
发明(设计)人: | 许嘉森;李国强;余刚;秦会娟 | 申请(专利权)人: | 广州益善生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 万志香;曾旻辉 |
地址: | 510663 广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | braf 基因突变 检测 特异性 引物 芯片 | ||
1.一种BRAF基因突变检测液相芯片,其特征是,主要包括有,
(A)针对BRAF的V600E突变位点,分别设计的野生型和突变型ASPE引物对:每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物组成,所述tag序列选自SEQ IDNO.25~SEQ ID NO.30中的任2条序列;所述特异性引物是来源于SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2或其反向互补序列中的碱基序列,且特异性引物的3’端的最后3位碱基中的一个碱基为突变位点,所述特异性引物的Tm值在52~58℃之间;
(B)分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的2种微球,所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.31~SEQ ID NO.36中的序列,且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对;
(C)用于扩增具有V600E突变位点的BRAF基因目标序列的扩增引物。
2.根据权利要求1所述的BRAF基因突变检测液相芯片,其特征是,所述扩增引物为SEQ IDNO.37和SEQ ID NO.38。
3.根据权利要求1所述的BRAF基因突变检测液相芯片,其特征是,所述野生型的特异性引物为SEQ ID NO.3~SEQ ID NO.7中的一条,所述突变型的特异性引物为SEQ ID NO.8~SEQID NO.12中的一条;或所述野生型的特异性引物为SEQ ID NO.15~SEQ ID NO.19中的一条,所述突变型的特异性引物为SEQ ID NO.20~SEQ ID NO.24中的一条。
4.根据权利要求1-3任一所述的BRAF基因突变检测液相芯片,其特征是,所述tag序列为SEQID NO.25和SEQ ID NO.26。
5.根据权利要求1-3任一所述的BRAF基因突变检测液相芯片,其特征是,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列。
6.根据权利要求5任一所述的BRAF基因突变检测液相芯片,其特征是,所述间隔臂序列为5-10个T。
7.用于BRAF基因V600E突变检测的特异性引物,其特征是,所述特异性引物是来源于SEQID NO.1和SEQ ID NO.2或其反向互补序列中的碱基序列,且特异性引物的3’端的最后3位碱基中的一个碱基为突变位点,所述特异性引物的Tm值在52~58℃之间。
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