[发明专利]人类多基因疾病关键基因的无向网络筛选方法无效
申请号: | 201010170331.1 | 申请日: | 2010-05-12 |
公开(公告)号: | CN102086473A | 公开(公告)日: | 2011-06-08 |
发明(设计)人: | 杨阔;徐勇;韩瑞发;张志宏;刘妍;张琚;郁春燕;王刚 | 申请(专利权)人: | 天津市泌尿外科研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G06F19/00 |
代理公司: | 天津市宗欣专利商标代理有限公司 12103 | 代理人: | 董光仁 |
地址: | 300211*** | 国省代码: | 天津;12 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 人类 多基因 疾病 关键 基因 网络 筛选 方法 | ||
1.一种人类多基因疾病关键基因的无向网络筛选方法,其是按以下步骤进行的:
①依据文献及基因表达谱芯片实验结果,收集疾病相关基因名称;
②在NCBI Gene,Gene Ontology及Online Mendelian Inheritancein ManTM数据库中注释相关基因功能;
③基因相互作用网络图构建:根据基因之间的功能关系,从一个差异表达基因A出发,连线链接下一个基因B,再由基因B出发连接与其关系密切的基因C……,以此类推,同时查找另外的差异表达基因D和基因E的功能,并用连线链接,获得整个疾病基因的相互作用网络;每个基因作为一个节点,用数字序号代表,而每两个基因联系的信号通路连线构成了网络的边,从而形成为一个无向网络模型;
④采用D(n)=(dij(n))n×n构造节点之间最短距离矩阵,
网络的凝聚度为节点数n与平均路径长度l乘积的倒数,
网络凝聚度的节点重要度用下式表示,
⑤根据节点重要度进行排序,选取相应的基因作为多基因疾病关键基因。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于天津市泌尿外科研究所,未经天津市泌尿外科研究所许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201010170331.1/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇:高致密度氧化镁靶材的制造方法
- 下一篇:一种环保型有机硅改性聚醚建筑密封胶