[发明专利]全细胞蛋白和基因相互作用网络分析系统

权利要求书

1.一种全细胞蛋白和基因相互作用网络，解析KEGG数据库，其特征在于将KEGG数据库的多种功能间相互做关系连通，并连接了所有常用蛋白相互作用数据库，共同构筑了全细胞网络分析系统。

2.根据权利要求1所述的对于KEGG的整合，其特征在于利用xpath技术对xml文件进行解析，解析结果保存和导入数据库。导入数据库的过程为：通过预定义的Sq1模板：创立数据库连接，创建数据表(若数据表不存在，存在则清空数据)，导入数据，提交并关闭数据库连接。

3.根据权利要求1所述的构建方法为：(1)在数据库中搜索满足筛选条件的基因的上游和下游基因，而该上游和下游基因须同时满足筛选条件；(2)根据基因与其上下游相互作用关系画出基因间连接线，基因用圆圈来表示，相互作用用线段表示，其标识为[1]。

4.根据权利要求1所述的对其他蛋白质相互作用数据库的整合，除了运用了kegg数据库，又新添加了数据库。

5.根据权利要求1所述的网络结构分析，为了发现网络中的核心调控基因，使用网络拓扑技术分析网络核心调控基因。