[发明专利]与猪生产性状相关的分子标记及制备与应用

说明书

技术领域

本发明属于猪标记辅助选择(MAS)技术领域，主要涉及到四种可用于猪标记辅助选择的分子标记的制备与应用。其中两个分子标记位于猪Pitx2c基因的外显子上，而另外两个分子标记位于Pitx2c基因的3’非翻译区。利用本发明中的四个分子标记对猪生产性状进行了关联分析，结果显示，这四种分子标记均可应用到猪的标记辅助选择中。

背景技术

肉类是人类营养的主要来源，而猪肉在所有肉类消费中所占的比例是最大的。随着社会的发展与人们生活水平的提高，人们对肉类的消费观念已由原来的对量的追求向质的追求转变。过去的几十年里，传统的育种方法在提高猪的生长速度，瘦肉率以及饲料转化率等方面发挥了积极重要的作用，并取得了显著的成绩，育种计划相当成功。但同时随着对高生长率与高瘦肉率的强度选择导致了猪肉品质的严重下降，特别是导致了肌肉脂肪的大幅度下降，劣质猪肉的大量涌现。因此，对猪肉品质的改良，培育出安全环保优质新品种猪成为目前猪遗传育种中的重要研究课题。

近年来，随着现代分子和基因组学突飞猛进的发展，分子育种越来越受到人们的关注。分子育种主要包括标记辅助育种，转基因育种和体细胞克隆育种，与其它两种分子育种相比，标记辅助育种简单易行，因此，对标记辅助育种的研究也相对较多。标记辅助育种就是利用DNA水平上的分子标记来进行猪种的遗传改良。而标记辅助选择就是通过寻找对动物特定性状有较大影响的数量性状位点附近的分子标记，然后通过这些分子标记来对特定性状进行选择的方法。相对传统的育种方法，标记辅助选择具有许多明显的优势，它不受年龄，性别等的限制，可以进行早期选种，缩短世代间隔，提高选择的准确性，提高选择的强度，降低选育的成本，加快遗传改良的进度；特别是对遗传力低的性状、晚期表现性状、以及活体难于度量的性状(肉质性状)更具有显著的优势。到目前为止，已成功鉴定了多个可用于猪育种的分子标记。其中氟烷(halothane gene，HAL)基因，也称兰尼定I型受体基因(ryanodine receptor 1，RYR1)或Ca²⁺释放通道基因(calcium release channel gene，CRC)，是被人们研究最多，研究最深的一个影响猪肉质性状的主效基因(Fujii et al.，Identification of a mutation in porcine ryanodine receptor associated with malignant hyperthermia.Science.1991，253，448-451)。带有氟烷隐性n等位基因的纯合个体(Halⁿⁿ)在应激情况下易产生应激综合症(PSS)，并且容易出现死亡，带有隐性n等位基因的猪在屠宰后也很容易出现劣质的PSE肉。第二个影响肉质的主要基因是酸肉基因(Rendement Napole，RN)，带有RN-等位基因的猪白肌中糖源的含量增量可达到70％，导致猪宰后24小时肌肉的最终pH值较低，并对腌制火腿产量有明显的影响(Le yo et al.，Evidence for a new major gene influencing meat quality in pigs.Genet Res，1990，55，33-40)。另外，胰岛素生长因子2(Insulin-like growth factor 2，IGF2)、黑皮质素受体4(Melanocortin receptor 4，MCR4)以及肌肉生长抑制素(Myostatin，MSTN)也被证明与肌肉的发育以及猪肉的品质具有显著的关系。上述几个分子标记对猪肉品质的形成具有较大的影响，它们都比较成功的应用到了猪肉品质改善的育种当中。此外，雌激素受体(Estrogen receptor，ESR)基因的DNA标记检测已在改善猪的繁殖性能中得以应用；牛的双肌(Double muscling，DM)基因与鸡的矮小(Dwarf，dw)基因也在育种和生产中应用。

肌肉的发育以及猪的肉质性状与胴体性状具有复杂的特性，而且许多性状只具有中等的遗传力，并且这些性状都是受多基因控制，其中很可能只有一个基因在起主要作用。另外，随着育种工作者对瘦肉的强度选择导致了猪肉品质的极度下降。迄今为止，虽然找到了少数几个影响猪生产性能的主效基因，但仅仅这几个主效基因还远远不能满足育种工作的需求。因此，找到更多的主效基因或与主效基因紧密连锁的遗传标记，并合理的运用到猪肉品质改良中，势必成为育种工作者们迫在眉睫的要事。