[发明专利]乙脑病毒的实时荧光定量PCR检测方法及试剂盒有效

专利信息
申请号: 201010225726.7 申请日: 2010-07-05
公开(公告)号: CN101942526A 公开(公告)日: 2011-01-12
发明(设计)人: 高正琴;贺争鸣 申请(专利权)人: 中国药品生物制品检定所
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64;C12N15/11
代理公司: 北京尚诚知识产权代理有限公司 11322 代理人: 鲁兵
地址: 10005*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 乙脑 病毒 实时 荧光 定量 pcr 检测 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.用于对乙脑病毒进行实时荧光定量PCR检测的引物和TaqMan探针,是根据乙脑病毒E基因保守区域的保守区域设计的,用以定量检测样本中乙脑病毒的核酸拷贝数。

2.根据权利要求1所述的引物和TaqMan探针,其特征在于:所述引物的上游引物具有序列表中SEQ ID NO:1的核苷酸序列,下游引物具有序列表中SEQ ID NO:2的核苷酸序列;所述TaqMan探针具有序列表中SEQ ID NO:3的核苷酸序列。

3.根据权利要求2所述的引物和TaqMan探针,其特征在于:所述TaqMan探针为经过荧光标记的,其5’端标记有报告荧光基团,3’端标记有淬灭荧光基团。

4.根据权利要求3所述的引物和TaqMan探针,其特征在于:所述报告荧光基团为FAM,荧光淬灭基团为NFQ。

5.一种乙脑病毒的实时荧光定量PCR检测方法,是以权利要求1-4任一项所述的引物和TaqMan探针进行的实时荧光定量PCR检测方法。

6.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于:检测中,20μL实时荧光定量PCR反应体系包括:TaqMan探针+引物1μL(TaqMan探针浓度250nM,上、下游引物浓度各为900nM),样品cDNA 1μL(1μg/mL),无RNA酶水8μL,TaqmanMix(TaqMan Gene Expression Master Mix 4369016,购自美国应用系统(ABI)公司)10μL。

7.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于:所述实时荧光定量PCR检测的反应条件为:先50℃2min;然后95℃10min;最后95℃15sec,60℃1min,共40个循环,在每个循环的延伸结束时进行荧光信号检测。

8.根据权利要求5或6或7所述的检测方法,其特征在于:所述检测方法还包括标准曲线的建立,方法为:用含乙脑病毒E基因的重组质粒pMD-JEV-E的DNA作为标准品,将其10倍系列稀释成8.86×109拷贝/μL、8.86×108拷贝/μL、8.86×107拷贝/μL、8.86×106拷贝/μL、8.86×105拷贝/μL、8.86×104拷贝/μL、8.86×103拷贝/μL、8.86×102拷贝/μL、8.86×101拷贝/μL。各取1μL质粒DNA作为模板DNA,进行实时荧光定量PCR检测,每份样本重复平行试验3次,得到用于乙脑病毒检测的标准曲线。

9.根据权利要求8所述的检测方法,其特征在于:所述建立标准曲线的20μL实时荧光定量PCR反应体系包括:TaqMan探针+引物1μL(TaqMan探针浓度250nM,上、下游引物浓度各为900nM),质粒DNA 1μL(0.0003219mg/mL),无RNA酶水8μL,Taqman Mix 10μL;实时荧光定量PCR反应条件与权利要求7相同。

10.一种用于对乙脑病毒进行实时荧光定量PCR检测的试剂盒,包括权利要求1-4任一项所述用于对乙脑病毒进行实时荧光定量PCR检测的引物和TaqMan探针。

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