[发明专利]乳腺癌预后28基因阵列检测系统

说明书

技术领域

本发明涉及一种乳腺癌预后28基因阵列检测系统。

背景技术

癌症影响着世界上1/3的人口。乳腺癌则是女性发病率最高的恶性肿瘤，全世界每年约有120万妇女蒙患乳腺癌，同时，50万人死于乳腺癌。中国是乳腺癌发病率增长最快的国家之一，国家抗癌协会公布的统计数字显示，近年来乳癌已占女性恶性肿瘤的32％，跃为城市中死亡率增长最快的癌症，尤以北京、上海、广州等大城市的发病率高居不下。

以上海为例，1972年，女性乳腺癌的发病率为每10万人中有17人；1992年，上升到每10万人中有34人；2000年，迅速上升至每10万人中有56.2人；2008年.已迅速上升至每10万人中有62.5人。统计显示：从1992年～2000年的短短8年间，已超过了1972～1992年20年的上升幅度。北京从1978年开始，乳腺癌亦成为妇女发病率最高的恶性肿瘤，近年来还在以每年2.4％的速度上升，现年发病率亦已经达到每10万人中有54人。简言之，中国主要城市10年来乳腺癌发病率增长了37％，死亡率增长了38.9％，农村死亡率更增长了39.7％。

西方乳腺癌的发病人数高峰期为50～55岁，随着妇女年龄的增长，发病率也越高。中国女性的乳腺癌发病年龄，要比西方妇女小10岁左右。显而易见，对乳腺癌的早期诊断与个性化的有效治疗，具有极其重要的全球意义.

尽管肿瘤发病的机理尚未清楚，但相关基因突变或其他环境因素所致表达水平异常，是致癌转变的根本原因已被广泛接受。癌症基因的突变和表达异常，在许多早期恶性肿瘤时就可出现。而对早期恶性肿瘤实现分子诊断，是以组织学观察作为主要诊断依据的现有病理分析方法的革命性飞跃，不仅可以确认各种肿瘤的分型和确诊，而且可以根据每个病人的肿瘤的生物学特点，预测其未来的病情发展并据此指导临床治疗方案。因此，建立迅速、有效，可靠、价廉的肿瘤标记物的分子诊断学技术，是当今肿瘤治疗的主要方向。

2007年2月，美国FDA批准了挪威Agendia Co.，Ltd的对乳腺癌预后70个基因表达进行测量的Mamma Print上市，该产品是基于基因芯片杂交技术，因此对样本的RNA质量要求很高，只能用新鲜组织来提取RNA。此外，该产品对样本的处理和信号读出设备要求也比较高，价格昂贵，而且由于杂交处理过程复杂，容易污染而产生假阳性，因而在临床上很难做到广泛推广。

近年来，美国国家肿瘤中心资助了多个大规模的实验。其中，美国加州Genomic Health Inc公司的Oncotype DX，对乳腺癌病人的术后肿瘤组织进行基因表达的检测，由于用了实时定量PCR技术，对组织的RNA保存要求大大降低，可从福尔马林固定甚至石蜡包埋后的肿瘤组织中测定相应的目标基因，并以此制定个性化的早期治疗方案，取得成功。

但是，Oncotype DX仅强调对乳腺癌的复发与转移的预后进行评估，未能为具有高复发转移风险的病人的化疗提供任何指导信息。Mamma Print则因为技术平台的复杂性与相对较高的假阳性率。而且两者都价格昂贵，一次检验需要4000美金以上因而难以在我国临床上有效推广。

发明内容

本发明所要解决的技术问题在于提供一种乳腺癌预后28基因阵列检测系统，以解决上述现有技术的缺陷。本发明采用精准快速的实时定量RT-PCR技术，能够对完整或降解后的靶基因mRNA片段进行特异性放大；并对结果进行独特的加权算法处理分析，能有效地排除假阳性与假阴性。

所述乳腺癌预后28基因阵列检测系统，首先通过收集特定乳腺癌病人样本，提取其中的RNA，然后进一步采用实时定量RT-PCR技术对靶基因mRNA片段进行特异性放大，经计算机软件分析，即可读出28基因的检测结果。

所述28基因具体如下：

a.细胞增殖相关基因：Ki67，STK15(丝氨酸/苏氨酸激酶-15)，Survivin，CCNB1(细胞周期蛋白B 1)，MYBL2(成髓细胞血症致病因子2)。

b.生长因子相关基因：GRB7(生长因子受体结合蛋白7)，HER2(人类表皮生长因子受体2)。

c.雌激素相关基因：ER(雌激素受体)，PGR(孕酮受体)，BCL2，SCUBE2(Signal peptide-CUB-epidermal growth factor-like domain-containing protein 2，信号肽CUB表皮生长因子类似结构域包含蛋白2)。