[发明专利]一种检测鸭群体中屠体性状的方法及试剂盒

说明书

技术领域

本发明涉及分子生物学技术领域，具体涉及检测鸭群体中屠体性状的方法及试剂盒。

背景技术

屠体性状一直都是畜牧业生产中重要的经济性状，也是肉鸭品种选育中的重要指标。长期以来，肉鸭屠体产量得到了显著的增加，主要归功于遗传选育。而随着家禽生产性状相关的遗传学研究的深入，大量的性状已经定位到染色体上较小的区间，为候选基因的研究以及后续遗传标记辅助育种的应用奠定了良好的基础。

SNP(Single Nucleotide Polymorphism，单核苷酸多态性)主要是指在基因组DNA序列上发生的单个核苷酸碱基的变异，包括(1)转换(Transition)，是指同型碱基(嘌呤与嘌呤，或嘧啶与嘧啶)之间发生的变化，如G/A，T/C；(2)、颠换(Transversion)，是指嘌呤与嘧啶之间发生的变化，如A/T，A/C，G/T，G/C；(3)插入或缺失突变(Insertion and Deletion，InDel)。在基因组中含有大量的SNP，禽类基因组大约100个碱基存在一个SNP，由于其分布广泛，同时适合大量快速筛查和基因分型分析，SNP标记已广泛的应用于基因定位、序列进化分析等研究，对在农业动物中进行的分子标记辅助育种选择也有巨大的促进作用。

胰岛素样生长因子结合蛋白7(Insulin-like Growth Factor bindingprotein 7，IGFBP7)是IGFBP超家族的一个成员，该基因家族的一个特点是编码蛋白质的N末端具有高度的相似性。IGFBP7能结合IGF-I、IGF-II和胰岛素，但亲和力相对较低[Oh Y，Nagalla SR，Yamanaka Y，Kim H-S，Wilson EM，Rosenfeld RG.Synthesis andcharacterization of insulin-like growth factor-binding protein(IGFBP-7).J Biol Chem(1996)271：30322-30325]，同时在衰老和肿瘤抑制中也发挥着功能[Sprenger CC，Damon SE，Hwa V，Rosenfeld RG，Plymate SR.Insulin-like growth factor binding protein-related protein 1(IGFBP-rP 1)is a potential tumor suppressor protein for prostate cancer.CancerRes(1999)59：2370-2375]。已知，IGF等激素对机体的生长起着极其重要的调控作用，因此，将IGFBP7基因作为候选基因研究其与生长性状(屠体性状)的关系对肉鸭的育种有很大的价值和意义。

发明内容

本发明的目的是提供一种用于检测鸭群体屠体性状的方法以及用于该屠体性状检测的试剂盒。

本发明发现鸭的IGFBP7基因的该单倍型或其中任一SNP作为标签与屠体性状具有显著相关的特性，可以作为鸭的遗传标记。

进而，本发明提供一种检测鸭群体屠体性状的方法，其是通过检测鸭IGFBP7基因的自5’端第11、97、114、216、221、367、371、390、392、400、和/或403-404位的核苷酸，来确定鸭群体的屠体性状。所述的鸭IGFBP7基因的核苷酸序列如SEQ ID No.1或2所示。如果待测鸭为具有SEQ ID No.1所示核苷酸序列的纯合体，其单倍型基因型为H1H1；如果待测鸭为具有SEQ ID No1和2所示核苷酸序列的杂合体，其单倍型基因型为H1H2；如果待测鸭为具有SEQ IDNo.2所示核苷酸序列的纯合体，其单倍型基因型为H2H2。

在心重和腹脂重中；H2H2基因型群体性状均值大于H1H1和H1H1基因型群体性状均值，H2H2型为优势基因型；而在其他不同的屠宰分割性状性状中，则H1H1基因型群体性状均值均大于H1H2和H2H2基因型群体性状均值，H1H1型为优势基因型。因而所述基因型可作为鸭群体屠体性状育种的辅助选择标记。

上述SNP位点可以通过扩增该段序列直接进行测序检测，或者用特异探针检测。本发明进一步包括用于鸭IGFBP7基因的自5’端第11、97、114、216、221、367、371、390、392、400、403-404位的核苷酸鉴定的探针或引物。

在本发明实施例中，优选的鉴定引物的核苷酸序列如SEQ IDNo.3和4所示。