[发明专利]关于基因表达的RNA测序质控方法及装置

权利要求书

1.一种关于基因表达的RNA测序的质控方法，其特征在于，所述方法包括：

对测序技术得到的测序片段分别进行数字基因表达谱分析(DGE)和转录组分析(RNA-Seq)；

所述数字基因表达谱分析的结果和所述转录组分析的结果分别与实时定量基因扩增荧光检测(qPCR)的结果进行相关性分析；

根据相关性分析结果，判断数字基因表达谱分析和转录组分析在基因表达定量上的差异，并从所述数字基因表达谱分析和转录组分析中选取一种测序分析方式；

从所选取的测序分析方式获取的分析结果中选取一百万标签数据(1M reads)，进行基因表达的测序稳定性分析。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述方法还包括：

采用高通量测序技术进行关于基因表达的RNA测序；

对所述数字基因表达谱分析的结果和所述转录组分析的结果分别进行去接头序列和去低质量序列的处理。

3.如权利要求1所述的方法，其特征在于，通过高通量测序技术对样品片段的基因表达进行多次测序，并对多次测序的数据取平均值以获得所述实时定量基因扩增荧光检测的结果。

4.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述数字基因表达谱分析的结果和所述转录组分析的结果分别与实时定量基因扩增荧光检测(qPCR)的结果进行相关性分析进一步包括：

当参考基因不全时，将数字基因表达谱分析的结果和转录组分析的结果分别与实时定量基因扩增荧光检测的结果进行相关性分析；和/或

在相同测序量的情况下，比较数字基因表达谱分析的结果和转录组分析的结果检测到的基因数。

5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述当参考基因不全时，将数字基因表达谱分析的结果和转录组分析的结果分别与实时定量基因扩增荧光检测的结果进行相关性分析的步骤进一步包括：

将所述参考基因从3’端到5’端平均切成三份；

对所述三份参考基因分别进行数字基因表达谱分析和转录组分析；

将所获得的分析结果分别与实时定量基因扩增荧光检测的结果进行相关性分析。

6.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述在相同测序量的情况下，比较数字基因表达谱分析的结果和转录组分析的结果检测到的基因数的步骤进一步包括：

从高通量测序得到的测序片段中取出三百万标签数据(3M reads)分别进行数字基因表达谱分析和转录组分析，从高通量测序得到的测序片段中取出两百万标签数据(2M reads)分别进行数字基因表达谱分析和转录组分析；和/或从高通量测序得到的测序片段中取出一百万标签数据(1M reads)分别进行数字基因表达谱分析和转录组分析；

在相同测序量的情况下，分别比较数字基因表达谱分析和转录组分析方法能够检测到的基因数。

7.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述从所选取的测序分析方式获取的分析结果中选取一百万标签数据(1M reads)，进行基因表达的测序稳定性分析的步骤进一步包括：

从数字基因表达谱分析结果中取出一百万标签数据(1M reads)，并将其与全部的数字基因表达谱分析结果进行相关性分析；和/或

从转录组分析结果中取出一百万标签数据(1M reads)，并将其与全部的转录组分析结果进行相关性分析。

8.一种关于基因表达的RNA测序的质控装置，其特征在于，所述装置包括：

基因表达测算模块，用于对测序技术得到的测序片段分别进行数字基因表达谱分析(DGE)和转录组分析(RNA-Seq)；

相关性分析模块，用于将所述数字基因表达谱分析的结果和所述转录组分析的结果分别与实时定量基因扩增荧光检测(qPCR)的结果进行相关性分析；

测序分析方式选取模块，用于根据相关性分析结果，判断数字基因表达谱分析和转录组分析在基因表达定量上的差异，并从所述数字基因表达谱分析和转录组分析中选取一种测序分析方式；

测序稳定性分析模块，用于从所选取的测序分析方式获取的分析结果中选取一百万标签数据(1M reads)，进行基因表达的测序稳定性分析。