[发明专利]诺卡噻唑菌素的生物合成基因簇及其应用有效

专利信息
申请号: 201010240885.4 申请日: 2010-07-23
公开(公告)号: CN101962647A 公开(公告)日: 2011-02-02
发明(设计)人: 刘文;丁莹;虞沂;潘海学 申请(专利权)人: 中国科学院上海有机化学研究所
主分类号: C12N15/31 分类号: C12N15/31;C12N15/52;C12N15/53;C12N15/54;C12N9/00;C12N15/63;C12N1/15;C12N1/19;C12N1/21;C12N5/10;C12P21/04;C12P21/02;C12P17/00
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 31100 代理人: 徐迅
地址: 20003*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 噻唑 菌素 生物 合成 基因 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种具有良好抗菌活性的抗生素-诺卡噻唑菌素的生物合成基因簇,其特征在于,包括编码诺卡噻唑菌素生物合成所涉及的37个基因,具体为:

1)负责诺卡噻唑菌素I大环骨架生物合成的基因,即noc28,noc20,noc21,noc22,noc23,noc9,noc24,noc30共8个基因:

noc28位于基因簇核苷酸序列第38434-38581个碱基处,长度为150个碱基对,编码诺卡噻唑菌素的前体肽,长度为49个氨基酸;

noc23位于基因簇核苷酸序列第30980-32875个碱基处,长度为1896个碱基对,编码杂环化蛋白,长度为631个氨基酸;

noc22位于基因簇核苷酸序列第29544-30983个碱基处,长度为1440个碱基对,编码NADH脱氢酶,长度为479个氨基酸;

noc21位于基因簇核苷酸序列第26965-29523个碱基处,长度为2559个碱基对,编码脱水酶,长度为852个氨基酸;

noc20位于基因簇核苷酸序列第25968-26960个碱基处,长度为993个碱基对,编码脱水酶,长度为330个氨基酸;

noc9位于基因簇核苷酸序列第14529-14584个碱基处,长度为456个碱基对,编码未知功能蛋白,长度为151个氨基酸;

noc24位于基因簇核苷酸序列第32902-34683个碱基处,长度为1782个碱基对,编码未知功能蛋白,长度为593个氨基酸;

noc30位于基因簇核苷酸序列第40176-40916个碱基处,长度为741个碱基对,编码未知功能蛋白,长度为246个氨基酸;

2)负责诺卡噻唑菌素I吲哚酸侧链生物合成的基因,即noc25,noc26,noc27,noc29,共4个基因:

noc27位于基因簇核苷酸序列第36848-37948个碱基处,长度为1101个碱基对,编码自由基SAM硫胺合成酶,长度为366个氨基酸;

noc25位于基因簇核苷酸序列第34680-35912个碱基处,长度为1233个碱基对,编码酰基-CoA合成酶,长度为410个氨基酸;

noc26位于基因簇核苷酸序列第35933-36820个碱基处,长度为888个碱基对,编码酰基转移酶,长度为295个氨基酸;

noc29位于基因簇核苷酸序列第38714-39976个碱基处,长度为1263个碱基对,编码SAM依赖的甲基转移酶,长度为420个氨基酸;

3)负责诺卡噻唑菌素I脱氧糖基生物合成的基因,即noc6,noc10,noc11,noc12,noc13,noc14,共6个基因:

noc10位于基因簇核苷酸序列第14990-15703个碱基处,长度为714个碱基对,编码N-双甲基转移酶,长度为237个氨基酸;

noc11位于基因簇核苷酸序列第15728-16972个碱基处,长度为1245个碱基对,编码NDP-己糖3位C上的甲基转移酶,长度为414个氨基酸;

noc12位于基因簇核苷酸序列第16984-17970个碱基处,长度为987个碱基对,编码NDP-己糖-3-酮还原酶,长度为328个氨基酸;

noc13位于基因簇核苷酸序列第17988-19418个碱基处,长度为1431个碱基对,编码dTDP-4-酮-6-脱氧葡萄糖2,3-脱水酶,长度为476个氨基酸;

noc14位于基因簇核苷酸序列第19424-20560个碱基处,长度为1137个碱基对,编码NDP-6-脱氧-D-葡萄糖4位C上的氨基转移酶,长度为378个氨基酸;

noc6位于基因簇核苷酸序列第11505-12683个碱基处,长度为1179个碱基对,编码糖基转移酶,长度为392个氨基酸;

4)细胞色素P450氧化还原酶基因,即noc7,noc15,noc16,noc18,noc19,共5个基因:

noc7位于基因簇核苷酸序列第12704-13912个碱基处,长度为1209个碱基对,编码细胞色素P450氧化还原酶,长度为402个氨基酸;

noc15位于基因簇核苷酸序列第20591-21703个碱基处,长度为1113个碱基对,编码细胞色素P450氧化还原酶,长度为370个氨基酸;

noc16位于基因簇核苷酸序列第21696-22934个碱基处,长度为1239个碱基对,编码细胞色素P450氧化还原酶,长度为412个氨基酸;

noc18位于基因簇核苷酸序列第23507-24649个碱基处,长度为1143个碱基对,编码细胞色素P450氧化还原酶,长度为380个氨基酸;

noc19位于基因簇核苷酸序列第24646-25926个碱基处,长度为1281个碱基对,编码细胞色素P450氧化还原酶,长度为426个氨基酸;

5)甲基转移酶基因,即noc8,noc36,共2个基因:

noc8位于基因簇核苷酸序列第13909-14532个碱基处,长度为624个碱基对,编码甲基转移酶,长度为207个氨基酸;

noc36位于基因簇核苷酸序列第43983-44768个碱基处,长度为786个碱基对,编码甲基转移酶,长度为261个氨基酸;

6)抗性基因,即noc17,noc37,共2个基因:

noc17位于基因簇核苷酸序列第22956-23480个碱基处,长度为525个碱基对,编码博来霉素抗性蛋白,长度为174个氨基酸;

noc37位于基因簇核苷酸序列第44914-45423个碱基处,长度为510个碱基对,编码磷酸盐ABC transporter,长度为169个氨基酸;

7)调节基因,即noc5,noc33,noc34,共3个基因:

noc5位于基因簇核苷酸序列第10404-11387个碱基处,长度为984个碱基对,编码SARP家族的转录调节蛋白,长度为327个氨基酸;

noc33位于基因簇核苷酸序列第42031-42456个碱基处,长度为426个碱基对,编码热休克蛋白,长度为141个氨基酸;

noc34位于基因簇核苷酸序列第42565-43173个碱基处,长度为609个碱基对,编码hsp18转录调节因子,长度为202个氨基酸;

8)负责转录翻译的基因,即noc1,noc2,noc3,noc4共4个基因:

noc1位于基因簇核苷酸序列第7731-8084个碱基处,长度为354个碱基对,编码50S核糖体蛋白L18,长度为117个氨基酸;

noc2位于基因簇核苷酸序列第8282-8785个碱基处,长度为444个碱基对,编码DGPFAETKE家族蛋白,长度为147个氨基酸;

noc3位于基因簇核苷酸序列第8731-9867个碱基处,长度为1137个碱基对,编码RNA聚合酶ECF-亚族的信号因子,长度为378个氨基酸;

noc4位于基因簇核苷酸序列第9968-10387个碱基处,长度为420个碱基对,编码ATP酶,长度为139个氨基酸;

9)未知功能基因,即noc31,noc32,noc35,共3个基因:

noc31位于基因簇核苷酸序列第41003-41410个碱基处,长度为408个碱基对,编码未知功能蛋白,长度为135个氨基酸;

noc32位于基因簇核苷酸序列第41492-41953个碱基处,长度为462个碱基对,编码未知功能蛋白,长度为153个氨基酸;

noc35位于基因簇核苷酸序列第43228-43758个碱基处,长度为531个碱基对,编码未知功能蛋白,长度为176个氨基酸。

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