[发明专利]与鸡缨头性状相关的Hoxc8基因及应用

说明书

技术领域

本发明涉及与鸡缨头性状相关的Hoxc8基因及检测鸡群体中缨头性状的试剂盒。

背景技术

丝羽乌骨鸡作为中国特有的地方鸡种，具有典型的十全性状，其外貌与其他鸡种相比有明显的差异，标准的丝羽乌骨鸡可概括为具有十大特征，又称为“十全”性状，包括：桑椹冠、缨头、绿耳、胡须、丝羽、五爪、毛脚、乌皮、乌肉、乌骨。其中，缨头性状是指存在于丝羽乌骨鸡头部的一簇长可及眼的毛冠，一般母鸡比公鸡明显。

1907年Davenport在题为《Heredity and Mendel′s Law》中提及缨头性状，指出缨头性状与丝羽性状相似，是一种显性性状。后来研究表明，缨头性状与Frizzle性状连锁，与显性白性状连锁，并且不断的得以确定。在中国农业大学资源家系中F0代A系(法国明星肉鸡)所有个体都没有缨头，C系(丝羽乌骨鸡)所有个体都有缨头，F1代个体表型为缨头，F2代有缨头个体与无缨头个体的分离比为3∶1(2324∶789)，正反交组间没有差异。

缨头性状是一类特异区域的羽毛形态差异而导致的外貌性状。鸟类的羽毛与哺乳动物的毛发相似，都属于皮肤组织的附属衍生物，毛囊的发育过程大致分为三个时期，即生长期(anagen)、退行期(catagen)及休止期(telogen)。研究发现，在毛囊发育的过程中，一类重要的转录因子家族-Hox基因家族，有多个成员参与到了这三个时期的发育调控之中。例如，在毛囊发生初期，Hoxc12，Hoxc13，Hoxc8对毛发的内髓鞘，皮层突起的发育，及退行期Hoxb4，Hoxc13对毛发外髓鞘及基质的正常发育，均起到调控作用。

动物胚胎前后轴由许多不同类型的细胞组成，胚胎中有一个复杂的遗传系统通过相应的信号指挥胚胎发生。这个系统的中心由一套结构相似的基因组成称为同源异形基因(Homeotic gene，Hox)，即Hox基因。现在研究发现，Hox基因与动物的形态发生紧密相关。昆虫、有爪动物、线虫、曳鳃动物、多毛纲、水蛭、纽形动物、扁形动物、腹足纲、鳃足纲、蛇、小鼠、文昌鱼、海胆和人类的Hox基因相互之间有很高的同源性。

在胚胎发育中，其在动物胚胎时期表达位置，与其在基因组上的排列顺序成相应关系，即位于基因组上靠3’端的家族成员，在胚胎发育时更倾向与在靠近头部的区域表达并行使相应的功能，反之靠近5’端的成员更倾向于在近尾部表达。例如，在模式生物果蝇中，Antp负责控制胸部区域的发育，而Ubx则负责中胸和腹节的发育。而近年研究发现，Hox基因家族成员并不是在所有的组织中都以这一共线性原则排列，特别是位于基因簇下游的Hoxc12，Hoxc13等成员在小鼠近头端舌突，胡须毛囊中的表达，更对这一曾经认为的共线性理论提出了新的理解。1998年，Hoxc13小鼠敲除模型成功，与对照相比其表型表现为在胡须，舌部毛囊和体表毛囊的发育上有缺陷。而2001年发现，转Hoxc13基因的转基因小鼠，体表被毛的发育变化，会产生接近裸鼠的表型，通过基因芯片分析发现，随着Hoxc13基因的表达量增高，一些在毛发组成中必须的角蛋白基因表达量产生了显著性的变化，更进一步确定了Hoxc13在小鼠毛囊发育中的特殊作用。

发明内容

本发明的目的是提供与鸡缨头性状相关的Hoxc8基因及应用。

本发明的另一目的是提供一种用于检测鸡中缨头性状的分子标记试剂盒。

为了实现本发明目的，本发明提供Hoxc8基因在鸡品种选育中的应用。

本发明还提供Hoxc8基因在选育具有缨头性状的鸡品种中的应用。

本发明还提供与鸡缨头性状相关的微卫星分子标记SSR5，其具有Seq ID No.1所示的核苷酸序列。

本发明还提供上述分子标记在选育具有缨头性状的鸡品种中的应用。

本发明还提供用于扩增SSR5微卫星分子标记的引物，其包括正向引物F：5’-CTGTCTCAGTGTGGCGGAGT-3’和反向引物R：5’-CGATCTCAAAGGCGTTGC-3’。

本发明还提供含有上述引物的检测试剂盒。

本发明进一步提供上述试剂盒在检测鸡缨头性状中的应用，具体方法为：以鸡的基因组DNA为模板进行PCR扩增反应，检测扩增产物。其中，PCR反应的退火温度为53.1℃。