[发明专利]遗传性疾病相关基因的鉴定方法有效
申请号: | 201010286309.3 | 申请日: | 2010-09-19 |
公开(公告)号: | CN102206701A | 公开(公告)日: | 2011-10-05 |
发明(设计)人: | 张朋;苏政;金鑫;唐北沙;王俊岭;翁翎 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因科技有限公司;中南大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人: | 程泳 |
地址: | 518083 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 遗传 性疾病 相关 基因 鉴定 方法 | ||
1.一种遗传性疾病相关基因的鉴定方法,其包括以下步骤:
1)针对遗传性疾病家系基因突变个体的全基因组DNA以及正常个体的全基因组DNA进行连锁分析,得到疾病相关基因的染色体初步定位;以及任选地,进一步进行疾病相关基因的染色体精细定位和单体型分析;
2)根据步骤1)的分析结果,利用人基因组外显子捕获技术对选自1)中的基因突变个体的全基因组DNA进行外显子捕获和分析,以此鉴定遗传性疾病的相关基因。
2.权利要求1的方法,其中所述遗传性疾病是指单基因遗传性疾病。
3.权利要求2的方法,其中所述单基因遗传性疾病是指遗传性脊髓小脑型共济失调。
4.权利要求1的方法,其中步骤1)中所述的连锁分析方法包括全基因组扫描的步骤,例如微卫星全基因组扫描或SNP全基因组扫描。
5.一种样品中遗传性脊髓小脑型共济失调相关基因的鉴定方法,其包括以下步骤:
1)测定待测样品中转谷氨酰胺酶6基因编码序列第1550位碱基或该基因10号外显子第214位碱基;
2)相应位置的碱基为T,则所述遗传性脊髓小脑型共济失调相关基因为野生型,相应位置的碱基为G,则所述遗传性脊髓小脑型共济失调相关基因为突变型。
6.权利要求5所述的方法,其中
步骤1)中转谷氨酰胺酶6基因第1550位碱基或其10号外显子的第214位碱基序列的测定采用PCR的方法,所述PCR引物对例如可以为SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示序列。
7.一种遗传性脊髓小脑型共济失调相关基因的检测剂,其至少包括根据转谷氨酰胺酶6基因编码序列或其10号外显子序列设计的PCR引物,所述引物用于PCR扩增,其扩增产物包含转谷氨酰胺酶6基因编码序列第1550位碱基或其10号外显子的第214位碱基序列,所述引物例如为SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示序列。
8.试剂盒,所述试剂盒至少包括:
1)根据转谷氨酰胺酶6基因编码序列或其10号外显子序列设计的引物,所述引物用于PCR扩增,其扩增产物包含转谷氨酰胺酶6基因编码序列第1550位碱基或其10号外显子的第214位碱基序列;所述引物例如为SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示序列;
2)任选地,包含用于PCR的DNA扩增酶和相应缓冲液。
9.权利要求8的试剂盒用于鉴定遗传性脊髓小脑型共济失调相关基因的用途。
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