[发明专利]生物分子数据的高效共享方法在审
申请号: | 201010288419.3 | 申请日: | 2010-09-21 |
公开(公告)号: | CN102411572A | 公开(公告)日: | 2012-04-11 |
发明(设计)人: | 陈平;宋立宇;鲁方;孔令印;王敏;王翊 | 申请(专利权)人: | 重庆诺京生物信息技术有限公司 |
主分类号: | G06F17/30 | 分类号: | G06F17/30;G06F19/18 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 401121 重庆市北*** | 国省代码: | 重庆;85 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 生物 分子 数据 高效 共享 方法 | ||
1.一种生物分子数据的高效共享方法,其特征在于:
选择每一种生物分子数据文件的数据结构中有意义的字段;
组合所述字段,直到每一种生物分子数据文件的数据结构中有意义的字段都被选择;
按照所述字段表达信息的逻辑排列组合所述字段,形成新的字段集合;
用所述集合中的字段生成生物分子数据文件的新数据结构;
使用拥有所述新数据结构的新生物分子数据文件承载读取到的生物分子数据文件中的数据。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于:按照下述步骤使用所述新数据结构承载读取到的生物分子数据文件中的数据:
读入生物分子数据文件到计算机内存中;
判断该生物分子数据文件采用的数据结构能否被正确识别,如果不能,反馈无法识别信息,结束操作,否则,
使用新生物分子数据文件数据结构与读入到计算机内存中的生物分子数据文件数据结构的字段对应关系,将该文件中数据结构字段的数据对应填充到新生物分子数据文件数据结构相应字段对应的数据空间。
3.如权利要求2所述的方法,其特征在于:所述生物分子数据文件为文本结构文件或数据库结构的文件。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于:如果所述生物分子文件为文本结构文件文件,逐行扫描读入到计算机内存中的生物分子数据文件,采用正则表达式识别该文件数据结构字段的数据。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于:按照字段之间的逻辑关联排列组合所述字段,使顺序排列在先的字段是在后字段的基础。
6.如权利要求2所述的方法,其特征在于:将能够被正确识别的生物分子数据文件采用的数据结构存储到模型数据库中,以及使用所述模型数据库中的数据判断生物分子数据文件采用的数据结构能否被正确识别。
7.如权利要求6所述的方法,其特征在于:存储新数据结构,如果一个能够被正确识别的生物分子数据文件的采用的数据结构被存储到模型数据库,用该生物分子数据文件的数据结构中有意义的字段补充新数据结构。
8.如权利要求1所述的方法,其特征在于:按照下述步骤组合所述字段形成字段组:
获得第一种生物分子数据文件的数据结构中有意义的字段,形成字段组;
对于获得的第二种以及以后的每一种生物分子数据文件的数据结构中有意义的字段,将与字段组中的字段不相同的字段补充进入字段组。
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