[发明专利]胃癌靶向DEC1基因的siRNAs表达载体的构建、筛选及其用途无效
申请号: | 201010288486.5 | 申请日: | 2010-09-21 |
公开(公告)号: | CN102041270A | 公开(公告)日: | 2011-05-04 |
发明(设计)人: | 汪运山;郏雁飞;郑燕;马晓丽;肖东杰;孙善会;魏炎 | 申请(专利权)人: | 汪运山 |
主分类号: | C12N15/85 | 分类号: | C12N15/85;C12N15/113;A61K48/00;A61P1/00;A61P35/00 |
代理公司: | 济南金迪知识产权代理有限公司 37219 | 代理人: | 李宝成 |
地址: | 250013 山东省济*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 胃癌 靶向 dec1 基因 sirnas 表达 载体 构建 筛选 及其 用途 | ||
1.靶向DEC1基因的siRNAs表达载体,其特征是,以pGreenPuro shRNA Cloning andExpression vector为载体,针对人分化型胚胎软骨发育基因1(DEC1)编码区上、下游的两段序列,在较高表达DEC1的胃癌细胞系BGC823中发挥RNA干扰作用;这两段DEC1特异性RNA干涉靶序列分别为:①5’-CATTGCCCTGCAGAGTGGTTTACAA-3’,起始于661位;②5’-CCAAGCTTAGCTTCTCAAAGGCCTAA-3’,起始于2476位,由以下方法制得:
(1)RNA干涉靶序列的选择及插入序列的设计与合成
选择DEC1基因编码区的两段序列①5’-CATTGCCCTGCAGAGTGGTTTACAA-3’、②5’-CCAAGCTTAGCTTCTCAAAGGCCTAA-3’,设计并分别体外合成两对互补的寡核苷酸序列,序列如下:
①DEC1寡核苷酸序列1:
正义链:
5’-GATCCCATTGCCCTGCAGAGTGGTTTACAACTTCCTGTCAGATTGTAAACCACTCTGCAGGGCAATGTTTTTG-3’
反义链:
5’-AATTCAAAAACATTGCCCTGCAGAGTGGTTTACAATCTGACAGGAAGTTGTAAACCACTCTGCAGGGCAATGG-3’
②DEC1寡核苷酸序列2:
正义链:
5’-GATCCCCAAGCTTAGCTTCTCAAAGGCCTAACTTCCTGTCAGATTAGGCCTTTGAGAAGCTAAGCTTGGTTTTTG-3’
反义链:
5’-AATTCAAAAAAATCCGGAAACTCTTCGATTCGAACCTCTGACAGGAAGTTAGGCCTTTGAGAAGCTAAGCTTGGG-3’
(2)将步骤(1)合成的两对寡核苷酸等量混匀,95℃作用4分钟后慢慢冷却至室温,然后将结合的双链寡核苷酸与线性化的pGreenPuro shRNA Cloning and Expression vector质粒载体连接,最后转化到JM109大肠杆菌,经氨苄青霉素筛选,挑选单个菌落大量培养,用质粒提取试剂盒提取纯化质粒DNA;
(3)质粒的鉴定
将步骤(2)提取的质粒DNA琼脂糖凝胶电泳,应用引物Forward sequencing primer H和Reverse sequencing primerH进行PCR鉴定,紫外分光光度计分析测定质粒DNA的浓度和纯度,并进行插入片断测序,以确定合成的寡核苷酸是否已正确转入pGreenPuro shRNACloning and Expression vector质粒中。
2.权利要求1的靶向DEC1基因的siRNAs表达载体在制备治疗表达DEC1的胃癌的基因药物中的应用。
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