[发明专利]一种PDGFRA基因突变检测液相芯片有效
申请号: | 201010292641.0 | 申请日: | 2010-09-21 |
公开(公告)号: | CN101984072A | 公开(公告)日: | 2011-03-09 |
发明(设计)人: | 许嘉森;余刚 | 申请(专利权)人: | 广州益善生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 万志香;曾旻辉 |
地址: | 510663 广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 pdgfra 基因突变 检测 芯片 | ||
1.一种PDGFRA基因突变检测液相芯片,其特征是,主要由以下组成:
(A)针对PDGFRA基因的突变位点,分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对:每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对突变位点的特异性引物组成,所述特异性引物是:针对V561D位点的SEQ ID NO.8~SEQ ID NO.9、针对DIMH 842-845del缺失突变和/或IMHD843-846del缺失突变的SEQ ID NO.10~SEQ ID NO.12、和/或针对D842V位点的SEQ ID NO.13~SEQ ID NO.14,所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.7;
(B)分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.15~SEQ ID NO.21中的序列,所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对,且所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;
(C)用于扩增具有V561D突变位点、DIMH 842-845del缺失突变和/或IMHD 843-846del缺失突变和/或D842V的突变位点的PDGFRA基因目标序列的扩增引物。
2.根据权利要求1所述的PDGFRA基因突变检测液相芯片,其特征是,所述扩增引物为:针对V561D突变位点的SEQ ID NO.22~SEQ ID NO.23、和/或针对DIMH 842-845del缺失突变和IMHD 843-846del缺失突变及D842V突变位点的SEQ ID NO.24~SEQ ID NO.25。
3.根据权利要求1所述的PDGFRA基因突变检测液相芯片,其特征是,所述ASPE引物对为:针对V561D突变位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.8组成的序列及由SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.9组成的序列;针对DIMHD 842-846野生型的由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.10组成的序列、针对DIMH 842-845del缺失突变的由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.11组成的序列和/或针对IMHD 843-846del缺失突变的由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.12组成的序列;和/或针对D842V突变位点的由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.13组成的序列及由SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.14组成的序列。
4.根据权利要求3所述的PDGFRA基因突变检测液相芯片,其特征是,
(A)所述ASPE引物对为:针对V561D突变位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.8组成的序列及由SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.9组成的序列;针对DIMHD 842-846野生型的由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.10组成的序列、针对DIMH 842-845del缺失突变的由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.11组成的序列和针对IMHD 843-846del缺失突变的由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.12组成的序列;和针对D842V突变位点的由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.13组成的序列及由SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.14组成的序列;
(B)分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.15~SEQ ID NO.21中的序列,所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对,且所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;
(C)所述扩增引物为:针对V561D突变位点的SEQ ID NO.22~SEQ ID NO.23、和针对DIMH842-845del缺失突变和IMHD 843-846del缺失突变及D842V突变位点的SEQ ID NO.24~SEQ ID NO.25。
5.根据权利要求1所述的PDGFRA基因突变检测液相芯片,其特征是,所述间隔臂序列为5~10个T。
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