[发明专利]差异表达基因的检测方法无效

专利信息
申请号: 201010293987.2 申请日: 2010-09-27
公开(公告)号: CN101974623A 公开(公告)日: 2011-02-16
发明(设计)人: 王军伟;石铁流;常畅;何静 申请(专利权)人: 华东师范大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;G06F19/00
代理公司: 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙) 31257 代理人: 董红曼
地址: 200062 上*** 国省代码: 上海;31
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 差异 表达 基因 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种差异表达基因的检测方法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)确定样本的数量;所述样本包括病例组样本、对照组样本、或多总体中每个总体的样本;

(2)通过数据读取单元,从基因芯片中获取基因表达值;

(3)先通过2进制-10进制数据转换单元,再通过以2为底对数的数据转换单元,将所述基因表达值转换成矩阵Xi,其中,矩阵Xi是第1到第k次方矩阵,i表示第i个样本,x表示数据转换后的值,k表示最高原点矩的次数,w表示获取样本的个数;

(4)通过数据处理单元进行样本检验;

A)当所述样本包括病例组样本和对照组样本时,通过双样本检验单元进行SWang检验,所述SWang检验是指其中,n是病例组样本的数量,m是对照组样本的数量,k是最高原点矩的次数,是病例组样本的基因表达值转换后的原点矩向量,是对照组样本的基因表达值转换后的原点矩向量,D1是病例组样本的基因表达值转换后的从第1次方到第k次方之间离差阵,D2是对照组样本的基因表达值转换后的从第1次方到第k次方之间离差阵;

B)当所述样本仅包括病例组样本时,通过单样本检验单元进行SWang检验,所述SWang检验是指其中,S0是已知分布的原点矩向量;C)当所述样本为多总体样本时,通过多样本检验单元进行SWang检验,所述SWang检验是指其中,d为多总体的数量,di为各个总体中的样本数量,sd为d个总体的样本数量之和,sd=d1+d2+…+dp

(5)通过分布识别单元进行分析,判断样本检验结果的分布,从而确定p值;

(6)通过比较单元得到检测结果,当所述p值小于0.05时,则判断所述样本之间的基因表达值存在差异。

2.如权利要求1所述差异表达基因的检测方法,其特征在于,所述步骤(2)中基因芯片包括实验制得的基因芯片。

3.如权利要求1所述差异表达基因的检测方法,其特征在于,所述步骤(4)中的k值最大为4。

4.如权利要求1所述差异表达基因的检测方法,其特征在于,所述步骤(5)中样本检验结果是符合F分布或卡方分布。

5.如权利要求1所述差异表达基因的检测方法,其特征在于,所述步骤(6)的样本之间的基因表达值的差异,可以通过公共基因数据库中已经发表的被证实的基因或实验来验证。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于华东师范大学,未经华东师范大学许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201010293987.2/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top