[发明专利]一种利用计算机模拟计算化学组分间相互作用参数的方法无效
申请号: | 201010511485.2 | 申请日: | 2010-10-11 |
公开(公告)号: | CN102446235A | 公开(公告)日: | 2012-05-09 |
发明(设计)人: | 任强;代振宇;王丽新;周涵 | 申请(专利权)人: | 中国石油化工股份有限公司;中国石油化工股份有限公司石油化工科学研究院 |
主分类号: | G06F17/50 | 分类号: | G06F17/50 |
代理公司: | 北京润平知识产权代理有限公司 11283 | 代理人: | 刘国平;顾映芬 |
地址: | 100728 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 计算机 模拟 计算 化学 组分 相互作用 参数 方法 | ||
1.一种利用计算机模拟计算化学组分间相互作用参数的方法,该方法包括:
1)利用MS软件的Visualizer模块画出待模拟的两种组分的分子式,得到分别与所述两种组分相对应的两个结构数据文件;
2)利用MS软件的Discover模块中的Minimize分别对所述两个结构数据文件进行能量最小化处理,得到两个能量最小化的结构数据文件;
3)利用MS软件的Forcite模块分别对所述两个能量最小化的结构数据文件进行结构优化,得到两个优化后的结构数据文件;
4)利用MS软件的Discover模块分别对所述两个优化后的结构数据文件进行分子动力学结构优化,并利用Discover模块中的analysis分别对优化得到的轨迹文件进行分析,寻找能量最低的构象;
5)利用MS软件的Blends模块分别对所寻找的能量最低的构象进行Blends计算,得到表格文件;以及
6)利用MS软件的Blends模块中的analysis对所述表格文件进行分析计算,得到所述两种组分在不同温度范围下的相互作用参数。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,在所述步骤2)中对所述两个结构数据文件进行能量最小化处理时,选用Smart Minimize方法、Compass力场以及1飞秒的时间步长。
3.根据权利要求1所述的方法,其中,在所述步骤3)中对所述两个能量最小化的结构数据文件进行结构优化时,选用Smart方法以及Dreiding力场。
4.根据权利要求1所述的方法,其中,在所述步骤4)中对所述两个优化后的结构数据文件进行分子动力学结构优化时,选用NVT系综、Andersen方法、Compass力场、1飞秒的时间步长以及500皮秒的总模拟时间,温度设为500K-800K,每计算500步输出一个结构。
5.根据权利要求4所述的方法,其中,对于重油分子体系而言,在所述步骤4)中对所述两个优化后的结构数据文件进行分子动力学结构优化时,温度设为650K。
6.根据权利要求1所述的方法,其中,在所述步骤5)中对所寻找的能量最低的构象进行Blends计算时,运算精度采用Ultra fine的运算精度,每一簇的相互作用次数设为200-2000,设定温度为298K,力场选用Dreiding力场,电荷选用Charge using QEq,能量计算精度采用Ultra fine,静电力和范得华力均采用Atom based。
7.根据权利要求6所述的方法,其中,对于重油分子体系而言,在所述步骤5)中对所寻找的能量最低的构象进行Blends计算时,每一簇的相互作用次数设为500。
8.根据权利要求1-7中任一权利要求所述的方法,其中,所述MS软件的版本为4.4。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国石油化工股份有限公司;中国石油化工股份有限公司石油化工科学研究院,未经中国石油化工股份有限公司;中国石油化工股份有限公司石油化工科学研究院许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201010511485.2/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇:用于智能卡个人化设备的智能写卡结构
- 下一篇:鼠标