[发明专利]一种类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因及其编码蛋白质和该基因的克隆无效
申请号: | 201010512666.7 | 申请日: | 2010-10-20 |
公开(公告)号: | CN101979579A | 公开(公告)日: | 2011-02-23 |
发明(设计)人: | 李慧;丛郁;常有宏;蔺经 | 申请(专利权)人: | 江苏省农业科学院 |
主分类号: | C12N15/29 | 分类号: | C12N15/29;C12N15/10;C07K14/415 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 孙忠浩 |
地址: | 210014 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 种类 磷酸酶 蛋白 基因 及其 编码 蛋白质 克隆 | ||
1.一种类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因,其特征在于:它源于蔷薇科植物的类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因,所述的类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因的核苷酸序列为序列表中SEQ ID NO:2的核苷酸序列外显子部分。
2.根据权利要求1所述的类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因,其特征在于:所述的类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因的核苷酸序列为序列表中SEQ ID NO:1的核苷酸序列。
3.根据权利要求1或2所述的类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因的编码蛋白质,其特征在于:编码蛋白具有序列表SEQ ID NO:3蛋白质活性多肽的氨基酸序列,而且所述的氨基酸序列与SEQ ID NO:1第1~801位的核苷酸序列所编码蛋白质至少有70%的同源性。
4.根据权利要求3所述的类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因的编码蛋白质,其特征在于:编码蛋白质的氨基酸序列SEQ ID NO:3是利用BioXM软件对SEQ ID NO:2的核苷酸序列外显子部分或SEQ ID NO:1的核苷酸序列进行翻译后获得;所述的SEQ IDNO:3为含有266个氨基酸残基的蛋白。
5.一种如权利要求1所述的类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因的克隆,其特征在于:首先提取蔷薇科植物的基因组DNA,克隆过程中通过上游引物SEQ ID NO:8和下游引物SEQ IDNO:9配对扩增SEQ IDNO:2序列。
6.一种如权利要求2所述的类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因的克隆,其特征在于:
利用RACE技术克隆未知基因,具体步骤为:利用上游引物SEQ ID NO:4和下游引物SEQ ID NO:5,以总RNA反转录而来的第一链cDNA为模板,通过RT-PCR获得SEQ ID NO:1序列的保守区片段;
根据SEQ ID NO:1序列的保守区片段的序列信息,设计基因特异上游引物SEQ IDNO:6和基因特异下游引物SEQ ID NO:7,通过基因特异上游引物SEQ ID NO:6与试剂盒中UPM引物配对进行RT-PCR扩增SEQ ID NO:1序列的3′末端序列;通过基因特异下游引物SEQ ID NO:7与试剂盒中UPM引物配对进行RT-PCR扩增SEQ ID NO:1序列的5′末端序列;将得到的SEQ ID NO:1序列的3′和5′末端序列和SEQ ID NO:1序列的保守区片段,进行拼接,最终获得PcCBL的cDNA全长;
所述的试剂盒为SMARTerTM RACE cDNA Amplification Kit。
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