[发明专利]一种类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因及其编码蛋白质和该基因的克隆无效

专利信息
申请号: 201010512666.7 申请日: 2010-10-20
公开(公告)号: CN101979579A 公开(公告)日: 2011-02-23
发明(设计)人: 李慧;丛郁;常有宏;蔺经 申请(专利权)人: 江苏省农业科学院
主分类号: C12N15/29 分类号: C12N15/29;C12N15/10;C07K14/415
代理公司: 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 代理人: 孙忠浩
地址: 210014 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 种类 磷酸酶 蛋白 基因 及其 编码 蛋白质 克隆
【权利要求书】:

1.一种类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因,其特征在于:它源于蔷薇科植物的类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因,所述的类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因的核苷酸序列为序列表中SEQ ID NO:2的核苷酸序列外显子部分。

2.根据权利要求1所述的类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因,其特征在于:所述的类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因的核苷酸序列为序列表中SEQ ID NO:1的核苷酸序列。

3.根据权利要求1或2所述的类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因的编码蛋白质,其特征在于:编码蛋白具有序列表SEQ ID NO:3蛋白质活性多肽的氨基酸序列,而且所述的氨基酸序列与SEQ ID NO:1第1~801位的核苷酸序列所编码蛋白质至少有70%的同源性。

4.根据权利要求3所述的类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因的编码蛋白质,其特征在于:编码蛋白质的氨基酸序列SEQ ID NO:3是利用BioXM软件对SEQ ID NO:2的核苷酸序列外显子部分或SEQ ID NO:1的核苷酸序列进行翻译后获得;所述的SEQ IDNO:3为含有266个氨基酸残基的蛋白。

5.一种如权利要求1所述的类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因的克隆,其特征在于:首先提取蔷薇科植物的基因组DNA,克隆过程中通过上游引物SEQ ID NO:8和下游引物SEQ IDNO:9配对扩增SEQ IDNO:2序列。

6.一种如权利要求2所述的类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因的克隆,其特征在于:

利用RACE技术克隆未知基因,具体步骤为:利用上游引物SEQ ID NO:4和下游引物SEQ ID NO:5,以总RNA反转录而来的第一链cDNA为模板,通过RT-PCR获得SEQ ID NO:1序列的保守区片段;

根据SEQ ID NO:1序列的保守区片段的序列信息,设计基因特异上游引物SEQ IDNO:6和基因特异下游引物SEQ ID NO:7,通过基因特异上游引物SEQ ID NO:6与试剂盒中UPM引物配对进行RT-PCR扩增SEQ ID NO:1序列的3′末端序列;通过基因特异下游引物SEQ ID NO:7与试剂盒中UPM引物配对进行RT-PCR扩增SEQ ID NO:1序列的5′末端序列;将得到的SEQ ID NO:1序列的3′和5′末端序列和SEQ ID NO:1序列的保守区片段,进行拼接,最终获得PcCBL的cDNA全长;

所述的试剂盒为SMARTerTM RACE cDNA Amplification Kit。

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