[发明专利]发热伴血小板减少综合征病毒的全基因序列及应用

说明书

技术领域

本发明涉及病毒学、分子生物技术领域，具体地说，涉及一种新的发热伴血小板减少综合征病毒的全基因序列及应用。

背景技术

布尼亚病毒是球形、有包膜和分节段负链RNA病毒。因首先从乌干达西部的布尼亚韦拉分离到该科的代表种-布尼亚韦拉病毒而得名。布尼亚韦拉病毒直径90～100纳米，从包膜伸出许多糖蛋白突起，内有3个螺旋对称的核壳，分别含大(L)、中(M)、小(S)3个RNA节段，其中L和M为负链RNA，分别编码病毒的多聚酶(RNA依赖的RNA多聚酶，RdRP)、糖蛋白(Gn和Gc)；S片段为双义RNA，编码核蛋白(NP)和非结构蛋白(NSs)。根据血清学和生物化学分析，已确定有5个属，即布尼亚病毒属、白蛉病毒属、汉坦病毒属、内罗病毒属和乌库病毒属，分别包含145、30、6、27和7个血清型。另有22个病毒被认为是本科的可能成员。

布尼亚病毒的自然感染见于许多脊椎动物和节肢动物(蚊、蜱、白蛉等)，可感染小鼠，并能在一些哺乳类、鸟类和蚊细胞培养中生长；对人可引起类似流感或登革热的疾病、出血热(立夫特谷热和克里米亚-刚果出血热等)及脑炎(加利福尼亚脑炎)。有蚊媒、蜱媒、白蛉媒三种传播类型。有些病毒在其节肢动物媒介中，可经卵、交配或胚胎期传播。

近年来，在我国河南、湖北、山东、江苏、辽宁等地陆续发现了发热伴血小板减少为主要临床表现的感染性病例，少数重症患者因多脏器损害，救治无效死亡。目前，这类患者病因尚不明确。该类病例临床表现为急性发热起病，多数患者伴有乏力、纳差、恶心、呕吐、腹痛、腹泻等症状，部分患者出现黑便、牙龈出血、皮肤瘀点或瘀斑、眼结膜充血等出血症状。绝大部分患者临床检查的结果为白细胞降低，血小板减少，部分患者谷丙/谷草转氨酶升高，尿蛋白呈阳性。为进一步明确该病的临床及流行病学特征，探索病因和防治手段，在湖北、山东、河南、江苏、辽宁等省部分地区开展监测工作。在对病原一无所知的情况下，通过非序列依赖的核酸扩增、病毒分离、核酸检测包括荧光定量PCR(Real-time PCR)和套式PCR、血清学检测等方法对上述地区的感染性病例进行病毒筛检和分离，同时进行病毒基因组学研究，对了解病毒来源、进化过程及分子流行病学有重要意义，同时也为疾病鉴别诊断以及疫苗的研制奠定了基础，具有巨大的经济和社会效益。

发明内容

本发明的目的是提供一种新的发热伴血小板减少综合征病毒，以及以湖北分离株HB29为代表的全基因序列及其氨基酸序列。

本发明的另一目的是提供该发热伴血小板减少综合征病毒的全基因序列及其编码的蛋白在制备预防或治疗由发热伴血小板减少综合征病毒所致传染病的药物、疫苗或诊断试剂中的应用。

为了实现本发明目的，本发明的发热伴血小板减少综合征病毒，该病毒基因组编码：

I)a、SEQ ID No.4所示氨基酸序列组成的蛋白，或

b、SEQ ID No.4所示氨基酸序列经替换、缺失或添加一个或几个氨基酸形成的由a所述蛋白衍生的具有同等功能的蛋白；例如在非活性区段，将第479位的V替换为I，不会影响蛋白的功能。

II)c、SEQ ID No.5所示氨基酸序列组成的蛋白，或

d、SEQ ID No.5所示氨基酸序列经替换、缺失或添加一个或几个氨基酸形成的由c所述蛋白衍生的具有同等功能的蛋白；例如在非活性区段，将第13位的L替换为F，不会影响蛋白的功能。

III)e、SEQ ID No.6所示氨基酸序列组成的蛋白，或

f、SEQ ID No.6所示氨基酸序列经替换、缺失或添加一个或几个氨基酸形成的由e所述蛋白衍生的具有同等功能的蛋白；例如在非活性区段，将第156位的A替换为T，不会影响蛋白的功能。

IV)g、SEQ ID No.7所示氨基酸序列组成的蛋白，或

h、SEQ ID No.7所示氨基酸序列经替换、缺失或添加一个或几个氨基酸形成的由g所述蛋白衍生的具有同等功能的蛋白；例如在非活性区段，将第144位的R替换为Q，不会影响蛋白的功能。

前述的病毒，该病毒基因组包括SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列，或与SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列同源性在95％以上的核苷酸序列。

本发明还提供前述发热伴血小板减少综合征病毒产生的多聚酶(RdRP)、糖蛋白(Gn和Gc)、核蛋白(NP)或非结构蛋白(NSs)。

本发明还提供编码前述多聚酶、糖蛋白、核蛋白或非结构蛋白的基因。