[发明专利]一种感知细胞中作用转录因子的方法

权利要求书

1.一种感知细胞中作用转录因子的方法，包括转录因子在基因启动子上匹配值计算，基因启动子甲基化对转录因子结合的作用描述，转录因子在基因启动子上结合值计算，转录因子在基因启动子上结合值与基因表达相关程度值计算，作用转录因子分析步骤；其特征是：分别在假定基因启动子甲基化不影响转录因子结合、甲基化抑制转录因子结合和甲基化促进转录因子结合的基础上，设计模型计算转录因子在基因启动子上的结合值，再分别计算转录因子在基因启动子上结合值与基因表达的相关程度值；当对特定转录因子，假定甲基化抑制转录因子结合得到的相关程度值大于不考虑甲基化作用得到的相关程度值，且考虑甲基化促进转录因子结合得到的相关程度值小于不考虑甲基化作用得到的相关程度值，则为该转录因子在该细胞中存在并对基因表达进行调控。

2.根据权利要求1所述的一种感知细胞中作用转录因子的方法，其特征是：所述模型采用E＝e^-((M-C)/S)/(1+e^-((M-C)/S))函数形式描述基因启动子甲基化对转录因子结合抑制作用的模型；其中，M是转录因子结合位点的甲基化水平，E是该结合位点上甲基化对转录因子的抑制作用、其取值范围为[0，1]；当结合位点的甲基化水平M非常小时，E将趋近1，表示甲基化对转录因子的结合无影响；反之，当M足够大时，E将趋近0，表示在甲基化影响下，转录因子无法在该位点结合；另外，模型有两个参数，分别是函数中心值C和函数陡度S。