[发明专利]一种基于概率神经网络集成的信号肽预测方法无效
申请号: | 201010596731.9 | 申请日: | 2010-12-21 |
公开(公告)号: | CN102012977A | 公开(公告)日: | 2011-04-13 |
发明(设计)人: | 孔祥增;王怡;郭躬德;陈丽萍 | 申请(专利权)人: | 福建师范大学 |
主分类号: | G06F19/12 | 分类号: | G06F19/12;G06F19/24;G06N3/08 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350007 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 概率 神经网络 集成 信号肽 预测 方法 | ||
1.一种基于概率神经网络集成的信号肽预测方法,其特征在于,实现步骤如下:
a.根据蛋白质性质对其进行编码,然后利用滑动窗口原理分割蛋白质序列;
b. 建立一组概率神经网络子分类器,分别用蛋白质序列样本进行分类训练,训练后得到一组信号肽分类模型;
c. 利用得到的各个模型分类测试数据集;
d. 统计各模型输出的分类结果,产生信号肽剪切位点候选集;
e. 采用多数投票法决策确定信号肽的剪切位点;
f. 采用5折交叉验证预测结果。
2.根据权利要求1所述的一种基于概率神经网络集成的信号肽预测方法,其特征在于:步骤a中的编码主要由以下三种方式,第一种编码方案,采用计算机能直接处理的数字序列来表示蛋白质序列;第二种编码方案,基于氨基酸残基物理化学特性来编码蛋白质;第三种编码方案,按照氨基酸的相对疏水值进行编码,转化成对应的十进制数;在经过编码之后,采用滑动窗口对编码后的蛋白质序列进行分割,并对样本分割后的样本进行抽样。
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