[发明专利]用于分离细菌的方法

权利要求书

1.一种鉴定或分离产生代谢产物的细菌的方法，该方法包括：

a)提供包含未表征细菌的样品；

b)对所述样品进行反复的辐射处理；

c)从所述经处理样品中鉴定或分离活的或者正在生长的细菌；以及

d)选择步骤c)中产生代谢产物的细菌。

2.权利要求1的方法，其中所述样品是环境样品或者来自环境样品，优选获自或来自土壤、水、温泉、海洋环境、淤泥、木材、石块、苔藓、植物提取物、地衣、生物材料、沉积物、泥炭地、生物膜、工业废水、气体、沙子、油、污水、动物或人排泄物。

3.权利要求1或2的方法，其中所述反复辐射处理是将大肠杆菌培养物中的细菌滴度降低至少2个对数级的处理。

4.权利要求1至3中任一项的方法，其中所述处理包括反复的辐射，所述辐射选自紫外线、γ射线和/或X射线辐射，单独地或者组合进行辐射，最优选反复的紫外线辐射。

5.权利要求1至4中任一项的方法，其中所述处理包括反复辐射，间隔为1至8小时之间、优选为3至5小时之间、最优选为约4小时。

6.权利要求4或5的方法，其中所述处理包括以1至8小时的间隔，对所述样品进行至少2次优选至少3次的紫外线处理，每次紫外线处理在0.5至400mJ/cm²之间、优选在1至200mJ/cm²之间、通常在1至100mJ/cm²之间。

7.权利要求1至6任一项的方法，还包括选择奇异球菌的步骤。

8.前述权利要求中任一项的方法，其中步骤b)在固体培养基中进行。

9.前述权利要求中任一项的方法，其中在步骤c)中鉴定或分离菌落。

10.前述权利要求中任一项的方法，其中步骤c)和d)是以任意顺序顺序地进行、或者同时进行。

11.前述权利要求中任一项的方法，其中步骤d)包括使步骤c)中鉴定或分离的细菌或其提取物暴露于一种或数种指示细胞，并且选择影响至少一种所述指示细胞的存活能力、生长、代谢、运动性、RNA表达、蛋白质表达、蛋白质分泌或病毒产生的细菌。

12.前述权利要求中任一项的方法，其中该方法包括分离或纯化所述代谢产物的进一步的步骤。

13.前述权利要求任一项的方法，其中所述代谢产物是药用化合物，优选自抗生素、抑菌化合物、抗代谢药、化学治疗化合物、抗寄生虫剂、抗真菌剂、抗病毒化合物、细胞因子活性化合物或细胞生长因子。

14.一种鉴定或分离产生抗生素或抑菌化合物的细菌的方法，该方法包括：

a)提供包含未表征细菌的样品；

b)对所述样品进行反复的辐射处理，优选反复的紫外线处理；

c)从所述经处理样品中鉴定或分离活的或正在生长的细菌；以及

d)使步骤c)中鉴定或分离的细菌或其提取物暴露于参照菌株，并且鉴定或分离显示抗生素或抑菌活性的细菌。

15.权利要求14的方法，还包括分离或纯化由所述细菌产生的抗生素或抑菌化合物的步骤。

16.前述权利要求中任一项的方法，其还包括选择在选择的培养条件，如培养基、营养素、温度、pH值、盐度、氧合、共培养、生物反应器或碳源下存活或生长的细菌的步骤。

17.前述权利要求中任一项的方法，其还包括以生物学、遗传学和/或化学方法对鉴定或分离的细菌或它们的DNA进行修饰以提高所述细菌的存活能力、生长或功能的步骤。

18.一种可通过权利要求1至17中任一项的方法获得的细菌，或其提取物。