[发明专利]用于诊断和预测移植物排斥的生物标志物板有效
申请号: | 201080012756.8 | 申请日: | 2010-01-11 |
公开(公告)号: | CN102439172B | 公开(公告)日: | 2017-03-01 |
发明(设计)人: | M·M·萨尔沃 | 申请(专利权)人: | 小利兰·斯坦福大学托管委员会 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司31100 | 代理人: | 余颖 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 诊断 预测 移植 排斥 生物 标志 | ||
1.一种监测已接受同种异体移植物的受治疗者的急性排斥(AR)反应的方法,所述方法包括:
(a)评估来自所述受治疗者的样品中至少一种基因的表达水平以获得基因表达结果,其中所述至少一种基因选自由以下组成的组:NKTR、MAPK9、DUSP1、PBEF1和PSEN1;和
(b)采用所述基因表达结果来在所述受治疗者中预测AR反应的发作、诊断AR反应、和/或表征AR反应,由此监测所述受治疗者的AR反应。
2.根据权利要求1所述的方法,其中评估NKTR、MAPK9、DUSP1、PBEF1和PSEN1的表达水平。
3.根据权利要求1所述的方法,其中所述评估步骤还包括评估以下的一种或多种的表达水平:CFLAR、RNF-130、IFNGR1、ITGAX和RYBP。
4.根据权利要求1所述的方法,其中所述评估步骤包括测定所述样品的所述至少一种基因的表达产物。
5.根据权利要求4所述的方法,其中所述表达产物是核酸转录物。
6.根据权利要求5所述的方法,其中所述评估步骤包括RT-PCR测定。
7.根据权利要求6所述的方法,其中所述RT-PCR测定是定量RT-PCR测定。
8.根据权利要求1所述的方法,其中所述样品是血液样品。
9.根据权利要求1所述的方法,其中所述同种异体移植物是肾同种异体移植物。
10.根据权利要求1所述的方法,其中采用所述基因表达结果来提前6到3个月预测AR反应的发生。
11.根据权利要求1所述的方法,其中所述方法还包括评估来自所述受治疗者的所述样品中选自表3或4的至少一种基因的表达水平,以获得第二基因表达结果,以及采用所述第二基因表达结果来确定所述受治疗者是否具有移植物耐受表型。
12.一种用于监测已接受同种异体移植物的受治疗者的急性排斥(AR)反应的系统,所述系统包括:
(a)基因表达评估元件,该基因表达评估元件配置为用于评估来自所述受治疗者的样品中至少一种基因的表达水平以获得基因表达结果,其中所述至少一种基因选自由以下组成的组:NKTR、MAPK9、DUSP1、PBEF1和PSEN1;和
(b)表型确定元件,该表型确定元件采用所述基因表达结果来在所述受治疗者中预测AR反应的发作、诊断AR反应、和/或表征AR反应,由此监测所述受治疗者的AR反应。
13.根据权利要求12所述的系统,其中所述基因表达评估元件包括用于测定样品的所述至少一种基因的表达产物的至少一种试剂。
14.根据权利要求13所述的系统,其中所述至少一种基因的所述表达产物是核酸转录物。
15.根据权利要求14所述的系统,其中所述基因表达评估元件包括对所述至少一种基因特异的PCR引物。
16.根据权利要求12所述的系统,其中评估全部NKTR、MAPK9、DUSP1、PBEF1和PSEN1的表达水平。
17.根据权利要求12所述的系统,其中所述基因表达评估元件还配置为用于评估以下的一种或多种的表达水平:CFLAR、RNF-130、IFNGR1、ITGAX和RYBP。
18.根据权利要求12所述的系统,其中所述表型确定元件包括所述至少一种基因的参考表达值。
19.一种用于监测已接受同种异体移植物的受治疗者的急性排斥(AR)反应的试剂盒,所述试剂盒包括:
(a)基因表达评估元件,该基因表达评估元件用于评估样品中至少一种基因的表达以获得基因表达结果,其中所述至少一种基因选自由以下组成的组:NKTR、MAPK9、DUSP1、PBEF1和PSEN1;和
(b)表型确定元件,该表型确定元件采用所述基因表达结果来在所述受治疗者中预测AR反应的发作、诊断AR反应、和/或表征AR反应,由此监测所述受治疗者的AR反应。
20.一种用于监测已接受同种异体移植物的受治疗者的急性排斥(AR)反应的计算机程序产品,其中当装载于计算机上时,所述计算机程序产品配置为采用来自从所述受治疗者获得的样品的基因表达结果来确定AR监测结果,和以用户可读格式向用户提供所述AR监测结果,其中所述AR监测结果选自在所述受治疗者中预测AR反应的发作、诊断AR反应、和/或表征AR反应,其中所述基因表达结果包括选自以下的一种或多种的表达数据:NKTR、MAPK9、DUSP1、PBEF1和PSEN1。
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