[发明专利]用于癌症诊断和癌症治疗监测的方法

权利要求书

1.一种诊断癌症的方法，所述方法包括以下步骤：

(a)测定分离自疑似癌症患者体液样品中由4至6种80至500bp片段代表的重复元件或多拷贝基因的DNA片段化模式，

(b)将步骤(a)中所测定的DNA片段化模式与分离自未患有癌症患者的参考样品中的DNA片段化模式相比较，

(c)测定与参考样品相比分离自诊断患者的样品中差异表达的所述DNA片段水平，

其中如果所述DNA片段水平基本上不同于参考样品中的水平，则表明所述诊断患者可能患有癌症。

2.权利要求1的方法，其中所述DNA片段化模式由5种片段代表。

3.权利要求2的方法，其中第一片段范围为80至160bp，第二片段范围为200至220bp，第三片段范围为240至260bp，第四片段范围为300至380bp以及第五片段范围为400至500bp。

4.权利要求1至3中任一项的方法，其中所述重复元件为LINE1、SINE1或LTR且所述多拷贝基因为U1RNA。

5.权利要求1至4中任一项的方法，其中所述重复元件为LINE1。

6.权利要求1至5中任一项的方法，其中所述体液为血液、血清、血浆、尿、骨髓、腹膜液或脑脊液。

7.权利要求1至6中任一项的方法，其中所述体液为血清或血浆。

8.权利要求1至7中任一项的方法，其中癌症为肝癌、乳腺癌、结肠癌、肺癌、前列腺癌、卵巢癌或胃癌。

9.权利要求1至8中任一项的方法，其中肝癌为原发性肝癌和继发性肝癌。

10.权利要求1至9中任一项的方法，其中原发性肝癌为肝细胞癌。

11.一种监测患有癌症且正接受癌症治疗的患者疾病进展或消退的方法，所述方法包括以下步骤：

(a)测定分离自治疗结束时监测患者体液样品中由4至6种80至500bp片段代表的重复元件或多拷贝基因的DNA片段化模式，

(b)将步骤(a)中所测定的DNA片段化模式与分离自同一个体治疗前的对照样品中的DNA片段化模式比较，

(c)测定与对照样品相比分离自监测治疗患者的样品中差异表达的所述DNA片段水平，

其中如果所述DNA片段水平基本上不同于对照样品的DNA片段水平，则表明与分离自同一患者的对照样品相比，监测患者的癌症可能处于较晚期或较早期，或所述监测患者可能对癌症治疗较不响应或较响应。

12.权利要求11的方法，其中所述DNA片段化模式由5种片段代表。

13.权利要求12的方法，其中第一片段范围为80至160bp，第二片段范围为200至220bp，第三片段范围为240至260bp，第四片段范围为300至380bp以及第五片段范围为400至500bp。

14.权利要求11至13中任一项的方法，其中所述重复元件为LINE1、SINE1或LTR且所述多拷贝基因为U1 RNA。

15.权利要求11至14中任一项的方法，其中所述重复元件为LINE1。

16.权利要求11至15中任一项的方法，其中所述体液为血液、血清、血浆、尿、骨髓、腹膜液或脑脊液。

17.权利要求11至16中任一项的方法，其中所述体液为血清或血浆。

18.权利要求11至17中任一项的方法，其中癌症为肝癌、乳腺癌、结肠癌、肺癌、前列腺癌、卵巢癌或胃癌。

19.权利要求11至18中任一项的方法，其中肝癌为原发性肝癌和继发性肝癌。

20.权利要求11至19中任一项的方法，其中原发性肝癌为肝细胞癌。