[发明专利]用于检测疟疾的探针和引物无效

专利信息
申请号: 201080017798.0 申请日: 2010-01-27
公开(公告)号: CN102414325A 公开(公告)日: 2012-04-11
发明(设计)人: 曼尤拉·贾甘纳特;钱德拉塞克哈尔·布哈斯卡拉恩·奈尔;皮拉里塞蒂·文卡塔·苏巴拉奥;穆拉克卡普斯·纳拉亚南·马诺杰;萨马曼迪里·马坎代亚赫·萨什雷克哈 申请(专利权)人: 彼格泰格私人有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;G01N33/48
代理公司: 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 代理人: 李丙林;张英
地址: 印度卡*** 国省代码: 印度;IN
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摘要:
搜索关键词: 用于 检测 疟疾 探针 引物
【权利要求书】:

1.有SEQ ID No.1、2和3的探针。

2.根据权利要求1所述的探针,其中所述探针用于检测疟疾。

3.根据权利要求1所述的探针,其中所述探针与在5′末端有荧光团和在内部区域或3′末端有猝灭剂的可检测的标记结合。

4.根据权利要求3所述的探针,其中所述荧光团选自包含荧光素及荧光素衍生物FAM、VIC、JOE、5-(2′-氨乙基)氨基萘-1-磺酸、香豆素及香豆素衍生物、荧光黄、德克萨斯红、四甲基罗丹明、6-羧基荧光素、四氯-6-羧基荧光素、5-羧基罗丹明和花青染料的组。

5.根据权利要求3所述的探针,其中所述猝灭剂选自包含四甲基罗丹明、4′-(4-二甲基氨基苯偶氮基)苯甲酸、4-二甲基氨基苯偶氮苯基-4′-马来酰亚胺、四甲基罗丹明、羧基四甲基罗丹明和BHQ染料的组。

6.根据权利要求4和5所述的探针,其中优选的荧光团是在5′末端的6-羧基荧光素[FAM],优选的猝灭剂是在3′末端的四甲基罗丹明[TAMRA],或在内部区域或3′末端的黑洞猝灭剂1(BHQ1)。

7.SEQ ID No.4或10、5、6、7、8、和9的引物。

8.根据权利要求7所述的引物,其中有SEQ ID No 4或10、5、和6的引物为正义引物,有SEQ ID No 7、8、和9的引物为反义引物。

9.根据权利要求8所述的引物,其中有SEQ ID No 4或10和7的引物对应于SEQ ID No.1的探针,有SEQ ID No 5和8的引物对应于SEQ ID No.2的探针,有SEQ ID No 6和9的引物对应于SEQ ID No.3的探针。

10.一种用于检测疟疾的PCR反应混合物,所述混合物包含待检测的样品、核酸扩增试剂、选自包含SEQ ID No.1、2、和3的组中的探针、以及选自包含SEQ ID No.4或10、5、6、7、8、和9的组中的相应引物。

11.根据权利要求10所述的反应混合物,其中有SEQ ID No 4或10和7的引物对应于SEQ ID No.1的探针,有SEQ ID No 5和8的引物对应于SEQ ID No.2的探针,以及有SEQ ID No 6和9的引物对应于SEQ ID No.3的探针。

12.根据权利要求10所述的反应混合物,其中疟疾感染是检测选自包含血液、唾液及尿液样品的组中的样品。

13.一种检测和可选地量化疟疾感染的方法,所述方法包含以下步骤:

(a)形成反应混合物,所述反应混合物包含待检测的样品、核酸扩增试剂、选自包含SEQ ID No.1、2、和3的组中的探针、以及选自包含SEQ ID No.4或10、5、6、7、8、和9的组中的相应引物;

(b)对所述反应混合物进行PCR以获得目的序列的拷贝,然后测量荧光信号的任何增加,从而检测疟疾感染;以及

(c)可选地从检测信号构造标准曲线,以获得拷贝数,从而量化所述疟疾感染。

14.根据权利要求13所述的方法,其中有SEQ ID No 4或10、5和6的引物是正义引物,有SEQ ID No 7、8和9的引物是反义引物。

15.根据权利要求14所述的方法,其中有SEQ ID No 4或10和7的引物对应于SEQ ID No.1的探针,有SEQ ID No 5和8的引物对应于SEQ ID No.2的探针,有SEQ ID No 6和9的引物对应于SEQ ID No.3的探针。

16.根据权利要求13所述的方法,其中所述荧光信号由在5′末端有荧光团和在内部区域或3′末端有猝灭剂的探针产生。

17.根据权利要求16所述的方法,其中所述荧光团选自包含荧光素及荧光素衍生物FAM、VIC、JOE、5-(2′-氨乙基)氨基萘-1-磺酸、香豆素及香豆素衍生物、荧光黄、德克萨斯红、四甲基罗丹明、6-羧基荧光素、四氯-6-羧基荧光素、5-羧基罗丹明和花青染料的组。

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