[发明专利]检测获得性免疫的方法有效
申请号: | 201080028875.2 | 申请日: | 2010-06-04 |
公开(公告)号: | CN102459643A | 公开(公告)日: | 2012-05-16 |
发明(设计)人: | 哈兰·S·罗宾斯;艾杜斯·H·沃伦;克里斯多佛·斯科特·卡尔森 | 申请(专利权)人: | 弗雷德哈钦森癌症研究中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人: | 王达佐;洪欣 |
地址: | 美国华*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 获得性免疫 方法 | ||
1.组合物,其包含:
(a)多种V-区段引物,其中每种引物都包含与单个功能性V区段或一小族V区段互补的序列;以及
(b)多种J-区段引物,其中每种引物都包含与J区段互补的序列;
其中所述V区段引物和J-区段引物允许通过多重聚合酶链式反应(PCR)扩增TCR或IG CDR3区,从而产生足以对TCR或IG基因的多样性进行定量的多种扩增的DNA分子。
2.如权利要求1所述的组合物,其中每种V-区段引物都包含与单个Vγ区段或一族相似Vγ区段互补的序列,且每种J区段引物都包含与Jγ区段互补的序列,并且其中V区段引物与J-区段引物允许扩增TCRγCDR3区。
3.如权利要求1所述的组合物,其中每种V-区段引物都包含与单个Vδ区段或一族相似Vδ区段互补的序列,且每种J区段引物都包含与Jδ区段互补的序列,并且其中V区段引物与J-区段引物允许扩增TCRδCDR3区。
4.如权利要求1所述的组合物,其中每种V-区段引物都包含与单个Vα区段或一族相似Vα区段互补的序列,且每种J区段引物都包含与Jα区段互补的序列,并且其中V区段引物与J-区段引物允许扩增TCRαCDR3区。
5.如权利要求1所述的组合物,其中每种V-区段引物都包含与单个Vβ区段或一族相似Vβ区段互补的序列,且每种J区段引物都包含与Jβ区段互补的序列,并且其中V区段引物与J-区段引物允许扩增TCRβCDR3区。
6.如权利要求1所述的组合物,其中所述V区段具有相似的退火强度。
7.如权利要求1所述的组合物,其中所有J区段引物均与相同的保守框架区基序退火。
8.如权利要求1所述的组合物,其中所述扩增的DNA分子从所述保守基序开始,在诊断上鉴定所述J区段,并且包含连接并延伸入所述V区段。
9.如权利要求1所述的组合物,还包含一组测序寡核苷酸,其中所述测序寡核苷酸与所述扩增的DNA分子内的区域杂交。
10.如权利要求1所述的组合物,其中所述扩增的DNA跨越V-D-J连接。
11.如权利要求1所述的组合物,其中所述V-区段或J-区段经选择含有利用密切相关序列的合并的序列错误校正。
12.如权利要求1所述的组合物,还包含用于从mRNA产生cDNA的通用C区段引物。
13.如权利要求5所述的组合物,其中所述V区段引物锚定在Vβ区段中相对于重组信号序列(RSS)的第-43位。
14.如权利要求5所述的组合物,其中所述多种V区段引物由至少14种对14种不同的Vβ基因具有特异性的引物组成。
15.如权利要求5所述的组合物,其中所述V区段引物具有选自SEQ ID NOS:1-45的序列。
16.如权利要求5所述的组合物,其中所述V区段引物具有选自SEQ ID NOS:58-102的序列。
17.如权利要求5所述的组合物,其中每个Vβ区段或一族Vβ区段都具有V区段引物。
18.如权利要求5所述的组合物,其中所述引物不跨越内含子/外显子边界。
19.如权利要求5所述的组合物,其中所述J区段引物与所述Jβ区段的保守元件杂交,并且具有相似的退火强度。
20.如权利要求5所述的组合物,其中所述多种J区段引物由至少5种对5种不同的Jβ基因具有特异性的引物组成。
21.如权利要求5所述的组合物,其中所述J区段引物具有选自SEQ ID NOS:46-57和483的序列。
22.如权利要求5所述的组合物,所述J区段引物具有选自SEQ ID NOS:103-113、468和484的序列。
23.如权利要求5所述的组合物,其中每个Jβ区段都具有J区段引物。
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