[发明专利]通过抑制针对胶原基因的天然反义转录物来治疗胶原基因相关的疾病

说明书

本发明涉及反义寡核苷酸，具体而言，其通过靶定胶原基因的天然反义多核苷酸，来调节胶原基因的表达和/或功能。本发明还涉及这些反义寡核苷酸的鉴定及其在治疗与胶原基因表达有关的疾病和病症中的用途。

发明领域

本申请要求保护提交于2009年6月16日的美国临时专利申请 61/187,384、提交于2009年12月16日的美国临时专利申请第 61/286,939号和提交于2009年12月16日的美国临时专利申请第 61/286,965号的优先权，所述申请通过引用以其整体结合于本文中。

本发明的实施方案包括调节胶原基因和相关分子的表达和/或功能的寡核苷酸。

发明背景

DNA-RNA和RNA-RNA杂交对于核酸功能的许多方面(包括 DNA复制、转录和翻译)而言为重要的。杂交对于探测特定核酸或者改变其表达的各种技术而言亦为主要的。反义核苷酸例如通过与靶 RNA杂交来扰乱基因表达，从而干扰RNA剪接、转录、翻译和复制。反义DNA具有附加的特征，该特征为DNA-RNA杂合体充当核糖核酸酶H消化的底物，该活性存在于大多数细胞类型中。可将反义分子递送到细胞中，这与寡脱氧核苷酸(ODN)的情况一样，或者它们如 RNA分子一样可由内源基因表达。FDA最近批准了一种反义药物， VITRAVENETM(用于治疗巨细胞病毒视网膜炎)，这反映了反义物具有治疗应用。

发明概述

在一个实施方案中，本发明提供通过使用靶定天然反义转录物的任何区域的反义寡核苷酸来抑制天然反义转录物的作用，引起相应有义基因的增量调节的方法。本文也考虑天然反义转录物的抑制可通过siRNA、核酶和小分子来达到，认为所述siRNA、核酶和小分子在本发明的范围之内。

一个实施方案提供在体内或体外调节患者细胞或组织中的胶原基因多核苷酸的功能和/或表达的方法，所述方法包括使所述细胞或组织与长度为5-30个核苷酸的反义寡核苷酸接触，其中所述寡核苷酸与以下多核苷酸的反向互补序列具有至少50％的序列同一性，所述多核苷酸包含在SEQ ID NO：4的核苷酸1-387、SEQ ID NO：5的核苷酸 1-561、SEQID NO：6的核苷酸1-335、SEQ ID NO：7的核苷酸1-613、 SEQ ID NO：8的核苷酸1-177和SEQID NO：9的核苷酸1-285之内的 5-30个连续核苷酸；从而在体内或体外调节患者细胞或组织中胶原基因多核苷酸的功能和/或表达。

在另一个实施方案中，寡核苷酸靶定胶原基因多核苷酸的天然反义序列，例如SEQID NO：4-9所述的核苷酸，以及其任何变体、等位基因、同源物、突变体、衍生物、片段和互补序列。反义寡核苷酸的实例如SEQ ID NO：10-29所述。

另一个实施方案提供在体内或体外调节患者细胞或组织中胶原基因多核苷酸的功能和/或表达的方法，所述方法包括使所述细胞或组织长度为5-30个核苷酸的反义寡核苷酸接触，其中所述寡核苷酸与胶原基因多核苷酸的反义物的反向互补序列具有至少50％的序列同一性；从而在体内或体外调节患者细胞或组织中胶原基因多核苷酸的功能和/或表达。

另一个实施方案提供在体内或体外调节患者细胞或组织中胶原基因多核苷酸的功能和/或表达的方法，所述方法包括使所述细胞或组织与长度为5-30个核苷酸的反义寡核苷酸接触，其中所述寡核苷酸与胶原基因反义多核苷酸的反义寡核苷酸具有至少50％的序列同一性；从而在体内或体外调节患者细胞或组织中胶原基因多核苷酸的功能和/或表达。

在一个实施方案中，组合物包含一种或多种与有义和/或反义胶原基因多核苷酸结合的反义寡核苷酸。

在另一个实施方案中，所述寡核苷酸包含一个或多个经修饰或取代的核苷酸。

在另一个实施方案中，所述寡核苷酸包含一个或多个经修饰的键。