[发明专利]用于胃肠癌的生物标志物

说明书

本申请涉及生物标志物，尤其涉及用于胃肠癌的生物标志物。

胃肠癌是侵袭胃肠道的组织和器官的一组癌症。胃肠癌的实例包括食道癌、胆囊癌、胃癌(stomach cancer)(胃癌(gastric cancer))、肝癌、胰腺癌、胆管癌、小肠癌、结肠直肠癌和肛门癌。结肠直肠癌包括结肠癌和直肠癌。

在美国，一些形式的胃肠癌每年新诊断超过25万例患者。

尽管技术有进步，但胃肠癌仍然难以治疗。

发明概述

根据本发明的一个方面，提供了胃肠癌特异性的生物标志物，所述的生物标志物包含：

(i)包含SEQ ID NO：1的核酸序列，或其片段或变体，或者包含所述核酸序列的核酸分子；或者

(ii)包含SEQ ID NO：2的氨基酸序列，或其片段或变体，或者包含所述氨基酸序列的氨基酸分子。

在这方面，SEQ ID NO：1对应于Engrailed-2(EN2)基因(GenBank参考号NM_001427)的核酸序列，而SEQ ID NO：2对应于由其编码的EN2蛋白(NCBI登录号P19622，gi21903415)。

优选地，所述胃肠癌选自食道癌、胆囊癌、胃癌、肝癌、胰腺癌、胆管癌、小肠癌、结肠直肠癌和肛门癌。优选地，所述结肠直肠癌选自结肠癌和直肠癌。

出人意料地，已经发现在胃肠癌中EN2基因显著地上调。

EN2基因编码包含同源域的转录因子，该转录因子在包括轴突导向和边界形成的早期发育中具有许多重要功能(综述于Morgan R，(2006).Engrailed：Complexity and economy of a multi-functional transcription factor.FEBS letters 580，2531-2533，其全部引入本文作为参考)。该转录因子的NCBI/GenBank参考号是NM_001427。尽管没有归因于它的诊断显著性，先前已报道其在乳腺癌中作为癌基因起作用(Martin，N.L.，Saba-El-Leil，M.K.，Sadekova，S.，Meloche，S.and Sauvageau，G.(2005)EN-2 is a candidate oncogene in human breast cancer.Oncogene 24，6890-6901，其全部引入本文作为参考)。EN2的基因产物是33kDa的蛋白质(EN2)。

优选地，所述其片段或变体包含：

(i)与SEQ ID NO：1具有至少约50％，或至少约60％，或至少约70％，或至少约75％，或至少约80％，或至少约85％，或至少约90％，或至少约95％，或至少约96％，或至少约97％，或至少约98％，或至少约99％的核酸序列同源性的核酸序列；在严格条件下与其可杂交的核酸序列；和/或与其互补的核酸序列；

(ii)与SEQ ID NO：2具有至少约50％，或至少约60％，或至少约70％，或至少约75％，或至少约80％，或至少约85％，或至少约90％，或至少约95％，或至少约96％，或至少约97％，或至少约98％，或至少约99％的氨基酸序列同源性的氨基酸序列；或者

(iii)由(i)的核酸序列编码的氨基酸序列。

换句话说，按照上述(iii)部分，优选的是所述的其片段或变体包含：

(A)由核酸序列编码的氨基酸序列，其中所述核酸序列与SEQ ID NO：1具有至少约50％，或至少约60％，或至少约70％，或至少约75％，或至少约80％，或至少约85％，或至少约90％，或至少约95％，或至少约96％，或至少约97％，或至少约98％或至少约99％的核酸序列同源性；

(B)由核酸序列编码的氨基酸序列，其中所述核酸序列在严格条件下与以下的核酸序列可杂交：与SEQ ID NO：1具有至少约50％，或至少约60％，或至少约70％，或至少约75％，或至少约80％，或至少约85％，或至少约90％，或至少约95％，或至少约96％，或至少约97％，或至少约98％，或至少约99％的核酸序列同源性的核酸序列；或者

(C)由核酸序列编码的氨基酸序列，其中所述核酸序列与以下的核酸序列互补：与SEQ ID NO：1具有至少约50％，或至少约60％，或至少约70％，或至少约75％，或至少约80％，或至少约85％，或至少约90％，或至少约95％，或至少约96％，或至少约97％，或至少约98％或至少约99％的核酸序列同源性的核酸序列。