[发明专利]改进的生物聚合物筛选

说明书

相关申请

本申请请求Heath等人2009年7月22日提交的申请号为PCT/SG2009/000258的国际专利申请(题为《同量异位氨基酸和其它物质的区分》)以及Heath等人2009年7月15日提交的申请号为61/225,881的美国临时专利申请(题为《改进的筛选基于珠的肽的方法和使用部分可裂解的肽的肽模拟文库》)的权益，其均通过引用并入本文。

发明领域

本文描述的是创造性的组合物以及涉及生物聚合物取样特别是生物聚合物部分取样的方法。

背景

拆分和混合合成方法已经被用于产生在小珠上的肽文库，每一珠含有单一肽分子。这样的文库被称为一珠一化合物(OBOC)文库。OBOC文库的普遍用途是从文库中鉴定执行一些感兴趣的功能的分子。例如，通过筛选文库与特定蛋白相关的珠(“命中(hit)”珠)，OBOC文库可以用来鉴定与所述蛋白结合的分子(即肽)。可以将命中珠从文库其余的珠分离，在特定命中珠上的肽的身份可以使用肽测序策略确定。

发明概述

本文描述的是创造性的组合物以及涉及生物聚合物取样特别是生物聚合物部分取样的方法。

在一个方面，提供了组合物。所述组合物包含第一生物聚合物和第二生物聚合物的混合物，其中除了在一或多个位置处第二生物聚合物含有可裂解接头外，所述第二生物聚合物与第一生物聚合物相同。

在一些实施方案中，第一生物聚合物和第二生物聚合物各自包含氨基酸序列。

在其它实施方案中，第一生物聚合物和第二生物聚合物各自包含核酸序列。

在仍然其它的实施方案中，第一生物聚合物和第二生物聚合物各自包含多糖。

在仍然其它的实施方案中，所述可裂解接头是甲硫氨酸。

在仍然其它的实施方案中，第一生物聚合物和第二生物聚合物与表面连接。

在仍然其它实施方案中，所述表面是颗粒的外表面。

在仍然其它实施方案中，第一生物聚合物与第二生物聚合物的比例大于1∶1。

在仍然其它实施方案中，所述组合物还包括多个所述混合物，其中每一混合物与单独的颗粒连接。

在仍然其它实施方案中，第一生物聚合物包含锚定氨基酸序列和N-末端氨基酸序列延伸。

在仍然其它实施方案中，第一生物聚合物包含锚定氨基酸序列和C-末端氨基酸序列延伸。

在仍然其它实施方案中，第二生物聚合物比第一生物聚合物长至少一个亚单元(subunit)。

在仍然其它实施方案中，第二生物聚合物比第一生物聚合物多包含至少一个氨基酸。

在仍然其它实施方案中，第二生物聚合物具有和第一生物聚合物相同数目的氨基酸。

在另一方面，提供了方法。所述方法包括在表面上生长生物聚合物，其中在生长步骤期间将可裂解接头前体添加至含有所述生物聚合物的介质并掺入所述生物聚合物，使得所述生长于表面上的生物聚合物仅一部分含有来源于所述可裂解接头前体的可裂解接头。

在仍然另一方面，提供了方法。所述方法包括使多个生物聚合物与至少一个表面混合并使所述多个生物聚合物与所述至少一个表面连接，使得与表面连接的所述生物聚合物仅一部分含有可裂解接头。

在一些实施方案中，所述可裂解接头前体包含至少一个氨基酸。

在其它实施方案中，将相对于所述序列的反应中心的少于1当量的所述可裂解接头前体添加至所述介质。

在仍然其它实施方案中，所述介质还包含可与所述可裂解接头区分的氨基酸前体。

在仍然其它实施方案中，所述氨基酸前体与所述可裂解接头前体的比例大于1∶1。

在仍然其它实施方案中，所述氨基酸前体与所述可裂解接头前体的比例大于5∶1。

在仍然其它实施方案中，所述氨基酸前体包含第一保护基团以及所述可裂解接头前体包含与第一保护基团不同的第二保护基团。

在仍然其它实施方案中，所述方法还包括在多个单独颗粒上生长生物聚合物，其中每一颗粒包含独特的生物聚合物。

在仍然另一方面，提供了组合物。所述组合物包含含有结合区和可裂解接头的生物聚合物，其中所述结合区和所述可裂解接头由足以使所述结合区对靶物质的结合亲和力的降低少于20％的距离分隔。