[发明专利]生物检测方法以及组合物

权利要求书

1.一种用于检测样本中生物体表型的方法，包括以下步骤：

获得一个样本；

使所述样本与一种分子倒置探针(MIP)接触，其中所述MIP包括与所述生物体中感兴趣的靶核酸序列同源性的两个区域以及两个探针扩增区域，其中使用对于所述表型具有特异性的MIP数据库来选择所述同源性的两个区域；

使所述MIP杂交到感兴趣的所述核酸序列上；

将感兴趣的所述靶核酸序列转化成环状DNA；

将所述环状DNA扩增；

从所述扩增的DNA中释放出所述MIP；

对所述扩增的DNA进行测序；以及

确定是否存在相应于所述表型的DNA序列。

2.权利要求1所述的方法，其中所述生物体选自以下构成的组中：细菌、病毒、真菌以及原生生物。

3.权利要求2所述的方法，其中所述细菌选自以下构成的组中：鼠疫耶尔森菌(Y.pestis)、布鲁菌属(Brucella)、禽致病性大肠杆菌(Avian pathogenic E.coli)、喹诺酮耐药性大肠杆菌(Quinolone resistant E.coli)、立克次体(Rickettsiae)、B族链球菌(Group B Streptococci)、鼻疽伯克菌(Burkholderia mallie)、副百日咳博德特氏菌(Bordetalla parapertusis)、耐药性恶性疟原虫(drug resistant P.falciparum)、结核分枝杆菌(M.tuberculosis)、霍乱弧菌(V.cholera)、炭疽芽孢杆菌(B.anthracis)、屎肠球菌(E.faecium)、土拉热弗朗西丝菌(F.tularensis)、百日咳博德特氏菌(B.pertussis)、以及甲氧西林耐受性金黄色葡萄球菌(methicillin resistant S.aureus)。

4.权利要求2所述的方法，其中所述病毒选自以下构成的组中：HIV-1、禽流感以及登革热病毒。

5.权利要求1所述的方法，其中所述扩增步骤是通过滚环扩增法(RCA)来实现的。

6.权利要求1所述的方法，其中所述测序步骤是通过多重测序来实现的。

7.权利要求1所述的方法，其中所述MIP数据库是一种单核苷酸多态性(SNP)数据库。

8.权利要求1所述的方法，其中所述MIP数据库是一种抗生素耐受性基因数据库。

9.权利要求1所述的方法，其中所述MIP数据库是一种毒力基因数据库。

10.权利要求1所述的方法，其中所述表型是抗生素耐受性。

11.权利要求1所述的方法，其中所述表型是毒力。