[发明专利]使用刻缺蛋白3拮抗剂来治疗刻缺蛋白1拮抗剂抗性癌症的方法

说明书

相关申请

依据35USC 119(e)，本申请要求2009年9月30日提交的临时申请号61/247298的权益，通过提及而将其内容收入本文。

发明领域

本发明涉及单独或组合使用刻缺蛋白1和刻缺蛋白3拮抗剂来治疗一般地癌症和具体地白血病的方法。还提供了用于治疗和诊断刻缺蛋白有关的癌症的组合物和方法。

序列表

本申请含有序列表，其已经经由EFS-Web以ASCII格式提交，并且在此通过提及而完整收录。2010年9月3日创建的所述ASCII拷贝命名为P4371.txt，并且大小为65,600个字节。

发明背景

刻缺蛋白(Notch)受体家族是一类进化上保守的跨膜受体，其在像海胆和人一样多种多样的生物体中转送影响发育的信号。刻缺蛋白受体及其配体德尔塔蛋白（Delta）和锯齿蛋白（Serrate）（在哺乳动物中称为Jagged）是跨膜蛋白，具有含表皮生长因子(EGF)样重复的大的胞外域。刻缺蛋白侧向同系物(paralogue)的数目在物种间有所不同。例如，哺乳动物中有四种刻缺蛋白受体（刻缺蛋白1-刻缺蛋白4）、秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)中有两种（LIN-12和GLP-1），而黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)中有一种（刻缺蛋白）。刻缺蛋白受体在转运至细胞表面期间在位点S1（其在跨膜域的N端）处被弗林蛋白酶样蛋白酶蛋白水解加工，生成胞外刻缺蛋白(ECN)亚基和刻缺蛋白跨膜亚基(NTM)。这两个亚基仍然是非共价联合的，并且构成成熟的异二聚体细胞表面受体。

刻缺蛋白1ECN亚基含有36个N端EGF样重复，接着是三个串联重复的Lin 12/刻缺蛋白重复(LNR)模块，之后有S1位点。刻缺蛋白3 ECN具有相似的结构，但是具有34个EGF样重复。每个LNR模块含有三个二硫键和预测为配位钙离子的一组保守的酸性和极性残基。活化性配体的结合位点位于EGF重复区内。刻缺蛋白1和刻缺蛋白3NTM包含胞外区（其含有S2切割位点）、跨膜区段（其含有S3切割位点）、和大的胞内区（ICN或ICD），其包括RAM域、锚蛋白重复、反式激活域和羧基端PEST域。ECN和NTM亚基的稳定联合取决于异二聚化域(HD)，其包含ECN的羧基端末端（称作HD-N）和NTM的胞外氨基端末端（称作HD-C）。在配体诱导的活化前，刻缺蛋白通过负调节区(NRR)维持静止构象，所述负调节区(NRR)包含三个LNR和HD域。

刻缺蛋白配体对ECN亚基的结合启动经由受调节的膜内蛋白水解发生的两次连续蛋白水解切割。由金属蛋白酶(ADAM17)在位点S2处进行的第一次切割使刻缺蛋白跨膜亚基易受在接近质膜的内部小叶的位点S3处的第二次切割。位点S3切割（其由含有早老蛋白和呆蛋白且促进γ-分泌酶活性的多蛋白复合物催化）解放刻缺蛋白跨膜亚基的胞内部分，容许其移位至细胞核，并激活靶基因的转录。（关于刻缺蛋白的蛋白水解切割的综述，见例如Sisodia等,Nat.Rev.Neurosci.3:281-290,2002）。

已经在人中鉴定出锯齿蛋白和德尔塔蛋白样类的5种刻缺蛋白配体（锯齿蛋白1（Jagged1，又称作Serrate1）、锯齿蛋白2（Jagged2，又称作Serrate2）、德尔塔蛋白样1（Delta-like 1，又称作DLL1）、德尔塔蛋白样3（Delta-like 3，又称作DLL3）、和德尔塔蛋白样4（Delta-like 4，又称作DLL4））。每种配体是一种一次通过跨膜蛋白，具有对于结合刻缺蛋白至关重要的保守N端德尔塔蛋白、锯齿蛋白、LAG-2(DSL)基序。在DSL基序C端的一系列EGF样模块在跨膜区段之前。与刻缺蛋白受体不同，配体在C端具有70-215个氨基酸的短的胞质尾部。另外，已经报告了其它类型的配体（例如，DNER、NB3、和F3/接触蛋白）。（关于刻缺蛋白配体和配体介导的刻缺蛋白活化的综述，见例如D’Souza等,Oncogene 27:5148-5167,2008）。