[发明专利]用于预测对HCV治疗持续应答的生物标志物无效
申请号: | 201080054518.3 | 申请日: | 2010-11-29 |
公开(公告)号: | CN102656459A | 公开(公告)日: | 2012-09-05 |
发明(设计)人: | S-H·邱;Y·朱 | 申请(专利权)人: | 弗·哈夫曼-拉罗切有限公司 |
主分类号: | G01N33/576 | 分类号: | G01N33/576 |
代理公司: | 北京市中咨律师事务所 11247 | 代理人: | 史文静;黄革生 |
地址: | 瑞士*** | 国省代码: | 瑞士;CH |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 预测 hcv 治疗 持续 应答 生物 标志 | ||
1.预测感染丙型肝炎病毒1型基因型(HCV-1)或丙型肝炎病毒4型基因型(HCV-4)的人对象对用干扰素、利巴韦林和HCV NS5B聚合酶抑制剂的治疗将实现持续的病毒学应答(SVR)的方法,其包括:
(i)提供来自在所述治疗之前(治疗前)所述对象的样品,
(ii)确定所述样品中选自CD30、MIG、TARC、TGFβ1、SDF1b,和Eotaxin-2的至少一种蛋白质的表达水平,和
(iii)将所述样品中的至少一种蛋白质的表达水平与代表源自对所述治疗未实现SVR的患者群体的治疗前的样品的至少一种蛋白质的表达水平的参照值对比;
其中,在所述样品中的至少一种蛋白质的统计学显著更高的表达水平指示了所述对象将对所述治疗实现SVR。
2.权利要求1的方法,其中确定至少两种蛋白质的表达水平。
3.权利要求1或2的方法,其中确定至少三种蛋白质的表达水平。
4.预测感染丙型肝炎病毒1型基因型(HCV-1)或丙型肝炎病毒4型基因型(HCV-4)的人对象对用干扰素、利巴韦林和HCV NS5B聚合酶抑制剂的治疗将实现持续的病毒学应答(SVR)的方法,其包括:
(i)提供来自所述治疗一周后(治疗后一周)的所述对象的样品,
(ii)确定所述样品中选自CD30、TRAIL,和TARC的至少一种蛋白质的表达水平,和
(iii)将所述样品中的至少一种蛋白质的表达水平与代表源自对所述治疗未实现SVR的患者群体中治疗后一周的样品的至少一种蛋白质的表达水平的参照值对比;
其中,在所述样品中的至少一种蛋白质的统计学显著更高的表达水平指示了所述对象将对所述治疗实现SVR。
5.权利要求4的方法,其中确定至少两种蛋白质的表达水平。
6.权利要求4或5的方法,其中确定至少三种蛋白质的表达水平。
7.预测感染丙型肝炎病毒I型基因型(HCV-1)或丙型肝炎病毒4型基因型(HCV-4)的人对象对用干扰素、利巴韦林和HCV NS5B聚合酶抑制剂的治疗将实现持续的病毒学应答(SVR)的方法,其包括:
(i)提供来自在所述治疗之前(治疗前)的所述对象的样品,
(ii)确定所述样品中选自HCC4、MIP1b、SDF1b、TNFRII、ITAC、MIG、IL2R,和IL16的至少一种蛋白质的表达水平,和
(iii)提供来自所述治疗一周后(治疗后一周)的所述对象的样品,
(iv)确定所述样品中选自HCC-4、MIP1b、SDF1b、TNFRII、ITAC、MIG、IL2R,和IL16的至少一种蛋白质的表达水平,
(v)确定来自所述对象的治疗前的样品和来自所述对象的治疗后一周的样品之间至少一种蛋白质的差异表达水平,和
(vi)将至少一种蛋白质的所述差异表达水平与代表下述至少一种蛋白质的差异表达水平的参照值对比,所述蛋白质源自对所述治疗未实现SVR的患者群体中的治疗前的样品和治疗后一周的样品;
其中,至少一种蛋白质差异表达水平的统计学显著改变指示了所述对象将对所述治疗实现SVR。
8.权利要求7的方法,其中确定至少两种蛋白质的差异表达水平。
9.权利要求7或8的方法,其中确定至少三种蛋白质的差异表达水平。
10.预测感染丙型肝炎病毒基因型1(HCV-1)或丙型肝炎病毒基因型4(HCV-4)的人对象对用干扰素、利巴韦林和HCV NS5B聚合酶抑制剂的治疗将实现持续的病毒学应答(SVR)的方法,其包括:
(i)提供来自所述治疗之前(治疗前)的所述对象的样品,
(ii)以皮克每毫升,确定所述样品中的IP10、CD30、TGFβ1和MIG的表达水平,并使用方程:SVR分数=-47.4-1.1xlog2IP10+3.1xlog2CD30+1.4xlog2TGFβ1+0.5xlog2MIG;
其中SVR分数大于或等于0.5指示了对象将对所述治疗实现SVR,而其中SVR分数小于0.5指示了对象将对所述治疗不实现SVR。
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