[发明专利]黑色素瘤特异性生物标志物

说明书

本申请涉及生物标志物，尤其涉及用于黑色素瘤的生物标志物。

黑色素瘤是在黑色素细胞中开始的一类皮肤癌症。其可以在痣（mole）中开始，也可以在其他有色组织中开始，例如在眼睛中或者在肠中开始。恶性黑色素瘤相对罕见，占所有皮肤癌症病例的10%。然而，恶性黑色素瘤还造成最多的死亡。在英格兰和威尔士，每年约有1500人死于恶性黑色素瘤。

尽管技术有进步，但黑色素瘤仍然难以治疗，尤其是当其未在早期发现时。

发明概述

根据本发明的一个方面，提供了黑色素瘤特异性生物标志物，所述的生物标志物包含：

（i）包含SEQ ID NO:1的核酸序列，或其片段或变体，或者包含所述核酸序列的核酸分子；或者

（ii）包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列，或其片段或变体，或者包含所述氨基酸序列的氨基酸分子。

在这方面，SEQ ID NO:1对应于Engrailed-2(EN2)基因(GenBank参考号NM 001427)的核酸序列，而SEQ ID NO:2对应于由其编码的EN2蛋白(NCBI登录号P19622,gi21903415)。

出人意料地，已经发现在黑色素瘤中EN2基因显著地被上调。

EN2基因编码包含同源域的转录因子，该转录因子在包括轴突导向和边界形成的早期发育中具有许多重要功能（综述于Morgan R,(2006).Engrailed:Complexity and economy of a multi-functional transcription factor.FEBS letters 580,2531-2533,其全部引入本文作为参考）。该转录因子的NCBI/GenBank参考号是NM 001427。尽管没有归因于它的诊断显著性，先前已报道其在乳腺癌中作为癌基因起作用(Martin,N.L.,Saba-El-Leil,M.K.,Sadekova,S.,Meloche,S.and Sauvageau,G.(2005)EN-2is a candidateoncogene in human breast cancer.Oncogene 24,6890-6901,其全部引入本文作为参考)。EN2的基因产物是33kDa的蛋白质（EN2）。

优选地，所述其片段或变体包含：

(i)与SEQ ID NO:1具有至少约50%，或至少约60%，或至少约70%，或至少约75%，或至少约80%，或至少约85%，或至少约90%，或至少约95%，或至少约96%，或至少约97%，或至少约98%，或至少约99%的核酸序列同源性的核酸序列；在严谨条件下与其可杂交的核酸序列；和/或与其互补的核酸序列；

(ii)与SEQ ID NO:2具有至少约50%，或至少约60%，或至少约70%，或至少约75%，或至少约80%，或至少约85%，或至少约90%，或至少约95%，或至少约96%，或至少约97%，或至少约98%，或至少约99%的氨基酸序列同源性的氨基酸序列；或者

(iii)由(i)的核酸序列编码的氨基酸序列。

换句话说，按照上述(iii)部分，优选的是所述的其片段或变体包含：

(A)由核酸序列编码的氨基酸序列，其中所述核酸序列与SEQ IDNO:1具有至少约50%，或至少约60%，或至少约70%，或至少约75%，或至少约80%，或至少约85%，或至少约90%，或至少约95%，或至少约96%，或至少约97%，或至少约98%或至少约99%的核酸序列同源性；

(B)由核酸序列编码的氨基酸序列，其中所述核酸序列在严谨条件下与以下的核酸序列可杂交：与SEQ ID NO:1具有至少约50%，或至少约60%，或至少约70%，或至少约75%，或至少约80%，或至少约85%，或至少约90%，或至少约95%，或至少约96%，或至少约97%，或至少约98%，或至少约99%的核酸序列同源性的核酸序列；或者

(C)由核酸序列编码的氨基酸序列，其中所述核酸序列与以下的核酸序列互补：与SEQ ID NO:1具有至少约50%，或至少约60%，或至少约70%，或至少约75%，或至少约80%，或至少约85%，或至少约90%，或至少约95%，或至少约96%，或至少约97%，或至少约98%或至少约99%的核酸序列同源性的核酸序列。