[发明专利]通过质谱分析的手段鉴定至少一种微生物的方法有效
申请号: | 201080057129.6 | 申请日: | 2010-10-14 |
公开(公告)号: | CN102656276A | 公开(公告)日: | 2012-09-05 |
发明(设计)人: | C·博利厄;Y·沙勒捷;J-P·沙里耶;S·沙泰利耶;P·迪富尔;C·弗兰切斯基;V·吉拉德;S·庞斯 | 申请(专利权)人: | 生物梅里埃公司 |
主分类号: | C12Q1/04 | 分类号: | C12Q1/04;C12Q1/14;C12Q1/18;G01N33/68 |
代理公司: | 永新专利商标代理有限公司 72002 | 代理人: | 林晓红 |
地址: | 法国迈合西*** | 国省代码: | 法国;FR |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 通过 谱分析 手段 鉴定 至少 一种 微生物 方法 | ||
1.从样品中鉴定至少一种微生物的方法,包括鉴别所述至少一种微生物以及确定分型、对至少一种抗微生物剂的潜在抗性及毒力因子的性质,特征在于对所述至少一种微生物的分型、对至少一种抗微生物剂的抗性及毒力因子的性质所进行的确定是通过质谱分析实施的,使用蛋白质、肽和/或代谢物作为所述分型、对至少一种抗微生物剂抗性及毒力因子的性质的标记。
2.权利要求1的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于对于分型、对至少一种抗微生物剂的潜在抗性及毒力因子的性质所实施的质谱分析是MS/MS型的质谱分析。
3.权利要求2的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于所述MS/MS质谱分析是MRM。
4.权利要求1-3任一项的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于对于分型、对至少一种抗微生物剂的抗性及毒力因子的性质所进行的确定是在相同的质谱分析装置中实施的。
5.权利要求4的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于对于分型、对至少一种微生物的抗性及毒力因子的性质所进行的确定是同时实施的。
6.前述任一项权利要求的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于鉴别所述至少一种微生物也是通过质谱分析实施的。
7.权利要求6的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于鉴别所述至少一种微生物的质谱分析是MS型、MS/MS型、或者MS型及随后MS/MS型的质谱分析。
8.前述任一项权利要求的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于其包括证实所述至少一种微生物的鉴别的额外步骤,所述证实步骤是通过质谱分析实施的。
9.权利要求8的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于所述证实步骤中的质谱分析是MS/MS型的质谱分析。
10.权利要求9的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于所述证实步骤中的质谱分析是MRM。
11.前述任一项权利要求的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于所述分型、对至少一种抗微生物剂抗性及毒力因子的性质的标记是所述至少一种微生物的蛋白质。
12.权利要求11的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于所述微生物的蛋白质被消化成肽。
13.权利要求12的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于所述消化是用酶来进行的。
14.权利要求13的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于所述酶是胰蛋白酶。
15.前述权利要求的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于所述至少一种微生物是细菌,并且所述抗微生物剂是抗生素。
16.权利要求15的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于所述细菌是金黄色葡萄球菌(Stphylococcus aureus)。
17.权利要求16的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于对分型性质的确定是使用具有SEQ ID No.2、3、4、5、6、7、8、10、11、12、13、14、15、16、17、19、20、21、23、24、26、27、29、30、32、34、35、37、38、40、42、44或45所示序列的至少一种肽。
18.权利要求16或17的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于对至少一种抗生素潜在抗性的性质的确定是使用具有SEQ ID No.10-17所示序列的至少一种肽。
19.权利要求16-18任一项的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于对毒力的确定是使用具有SEQ ID No.19、20、21、23或24所示序列的至少一种肽。
20.权利要求16-19任一项的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于所述鉴别是使用具有SEQ ID No.26、27、29、30、32、34、35、37、38、40、42、44和45所示序列的至少一种肽。
21.权利要求15的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于所述细菌是大肠杆菌(Escherichia.coli)。
22.权利要求21的鉴定至少一种微生物的方法,特征在于对分型性质的确定是使用具有SEQ ID No.46-87所示序列的至少一种肽。
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